PanWheatGrain

Grain Pangenomics for Durum Wheat Sustainable Production

PanWheatGrain

RIASSUNTO

Il progetto mira a:

1. Caratterizzare una core collection di frumenti tetraploidi, cresciuti in condizioni standard e anche a basso contenuto di azoto, per i seguenti caratteri target: NUE, accumulo di proteine e amido nei frumenti, in relazione alla produttività.
2. Assemblare e annotare il pangenoma di frumento tetraploide basandosi su A) dieci genomi di frumenti tetraploidi diversi e rappresentativi utilizzando PacBio HiFi B) Caratterizzare i relativi trascrittomi.
3. Caratterizzare la struttura, il contenuto in geni, la diversità genetica e la regolazione funzionale dei geni delle proteine di riserva nei frumenti tetraploidi. Definire le vie biosintetiche/metaboliche e le reti di regolazione genica rilevanti per il contenuto di proteine e amido nei frumenti, la dimensione dei frumenti e/o i biomarcatori metabolici di questi caratteri.
4. Elucidare il ruolo funzionale e la diversità funzionale in famiglie/classi geniche target definite, comprese le famiglie geniche che controllano la disponibilità dei nutrienti e il riempimento della cariosside, i fattori di trascrizione implicati nella crescita, assimilazione dell’azoto e ripartizione del carbonio.
5. Utilizzare GWAS, analisi meta-QTL e associazione aplotipo-fenotipo per identificare regioni genomiche rilevanti per il controllo genetico dei caratteri target e, attraverso l’integrazione di genomica funzionale e predizione bioinformatica, ottenere informazioni sulle possibili cause.
6. Utilizzare l’editing genomico per generare nuove varianti alleliche in geni chiave.
7. Preparare strumenti adeguati per la selezione e il breeding.

Codice Identificativo: CUP J83C20002000005

Costo totale del progetto: € 738.864,00

Costo totale DAFNE: € 197.544

Ruolo DAFNE: Operational Unit
Responsabile Scientifico DAFNE: Stefania Masci

Email: masci@unitus.it

Data inizio: 08/05/2022

Data fine: 07/05/2025

LINK

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PARTNERNARIATO/PARTNERSHIP

Università di Bologna, Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari (capofila)

Università di Udine, Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali

CNR, Istituto di Biologia e Biotecnologia Agraria, Milano

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