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Percorso Formativo

INSEGNAMENTOSEMESTRECFUSSDLINGUA
14962 - MATEMATICA E PRINCIPI DI STATISTICA

LUCA SECONDI

Primo Semestre 7MAT/05ita

Obiettivi formativi

Il corso di Matematica e principi di Statistica si propone di fornire agli studenti gli strumenti di base dell'analisi matematica e della statistica al fine di essere in grado di studiare, analizzare e discutere situazioni e fenomeni reali attraverso l'utilizzo di modelli matematici e strumenti statistici.
Con specifico riferimento ai descrittori di Dublino, l'insegnamento declina gli obiettivi formativi come segue:

Conoscenza e capacità di comprensione : al termine del corso gli studenti acquisiranno una conoscenza specifica sulle metodologie di analisi matematica e statistica per leggere, descrivere, specificare e interpretare un fenomeno reale attraverso strumenti tecnici di natura matematica e statistica. Con riferimento agli argomenti di analisi matematica, gli studenti svilupperanno conoscenze metodologiche e saranno forniti degli strumenti base per lo studio di funzioni lineari e trascendenti sia attraverso lo studio dei limiti che del calcolo differenziale e saranno, altresì, in grado di elaborare problemi reali attraverso l’uso dell’algebra lineare e del calcolo matriciale. Per quanto riguarda le nozioni di statistica, lo scopo del corso è quello di fornire agli studenti la conoscenze metodologiche e capacità di utilizzare metodi e strumenti per: a) l’analisi descrittiva dei dati; b) l’introduzione allo studio di fenomeni in condizioni di incertezza, attraverso le nozioni della teoria della probabilità e variabili aleatorie; c) lo studio delle relazioni tra variabili sia da un punto di vista descrittivo che di introduzione alla modellazione attraverso funzioni lineari.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione: al termine del corso, gli studenti avranno acquisito conoscenze metodologiche e capacità analitiche e saranno in grado di interpretare in autonomia analisi e ricerche empiriche sulle più rilevanti aree di intervento, anche applicate, pertinenti e affini al corso di laurea. Gli studenti saranno in grado di: i) valutare i risultati delle analisi empiriche; considerare l’appropriatezza delle metodologie matematiche e statistiche utilizzate; individuare gli eventuali limiti delle analisi svolte e considerare l’utilizzo di approcci alternativi;.

Autonomia di giudizio: il corso è volto a favorire un approccio critico sull’utilizzo dei differenti approcci, metodi e tecniche per la modellazione matematico-statistica e di analisi dei dati per l’interpretazione dei fenomeni applicati negli ambiti di interesse del corso di laurea. Gli studenti: i) svilupperanno capacità critiche sull’utilizzo di vari metodi in relazione agli obiettivi di analisi del fenomeno oggetto di studio; ii) saranno in grado di valutare l’apporto di una specifica metodologia di analisi matematica e di analisi dei dati allo studio di fenomeni reali, anche complessi; iii) svilupperanno la capacità di integrare coerentemente il contributo fornito dai metodi di analisi quantitativa con le competenze interdisciplinari dello studente.

Abilità comunicative: gli studenti avranno maturato competenze specifiche per comunicare in maniera univoca e chiara lo schema di analisi adottato per lo studio empirico e per modellare, attraverso l’analisi matematica e la statistica, fenomeni reali. La capacità di comunicazione efficace sarà validata anche attraverso la verifica delle capacità logico-argomentative e di sintesi.

Capacità di apprendimento: le metodologie didattiche utilizzate durate il corso e l'utilizzo di modalità di verifica dell’apprendimento focalizzate sullo studio di funzioni reali e analisi di problemi basati sullo studio di distribuzioni empiriche contribuiranno a rafforzare la capacità di autonomia di giudizio e lo sviluppo di competenze di auto-apprendimento da parte degli studenti.

Scheda Docente

Programma del corso

Nozioni introduttive: richiami di calcolo numerico. Unità di misura e fattori di conversione. Operazioni. Notazione scientifica. Approssimazioni. Uguaglianze e disuguaglianze. Percentuali. Elementi di geometria analitica: coordinate cartesiane. Rette e segmenti. Coniche. Equazioni e disequazioni.Nozioni di teoria degli insiemi.
Statistica descrittiva di base e analisi dei dati: distribuzione di un carattere statistico e sua rappresentazione grafica. Misure di posizione, variabilità e forma di una distribuzione. Analisi dell’associazione tra due caratteri, il metodo dei minimi quadrati ed introduzione ai modelli di regressione lineare.
Nozione di funzione e proprietà. Funzioni algebriche: funzioni lineari, quadratiche, polinomiali, funzioni potenza e funzioni razionali. Funzioni trascendenti: funzioni esponenziali e logaritmiche. Introduzione alle funzioni trigonometriche. La composizione funzionale. L’inversione funzionale. La definizione a tratti. Introduzione alla modellistica per sistemi a tempo discreto.
Algebra lineare: vettori, spazi vettoriali, rappresentazione geometrica dei vettori, dipendenza e indipendenza lineare. Matrici e determinanti. Rango di una matrice. Operazioni sulle matrici. Sistemi di equazioni lineari. Teorema di Rouché-Capelli. Regola di Cramer. Autovalori e autovettori.
Calcolo combinatorio ed elementi di teoria della probabilità. Nozione di evento. Distribuzioni di probabilità. Assiomi della probabilità. Eventi indipendenti e incompatibili. Probabilità condizionata. Teorema di Bayes. Variabili casuali e distribuzioni di probabilità. Introduzione all’inferenza statistica ed alla teoria dei test di ipotesi.

Definizione di limite, proprietà e calcolo dei limiti. Limiti di funzioni, continuità e asintoti. Studio qualitativo delle funzioni.
Definizione e calcolo delle derivate: funzioni algebriche e funzioni trascendenti. Crescenza e decrescenza. Minimi e massimi. Concavità e convessità. Sviluppo di Taylor. Cenni alle derivate parziali.
Calcolo integrale: definizione di integrale, proprietà dell’integrale. Integrale indefinito. Integrazione per parti, integrazione per sostituzione. Integrali definiti.

Modalità Esame

L'esame consiste in una PROVA SCRITTA che comprende quesiti pratici e teorici e si intende superato conseguendo un voto almeno pari a 18/30.
La prova scritta è strutturata con lo scopo di verificare la comprensione degli argomenti trattati nel corso e la capacità di applicare correttamente le nozioni teoriche nella risoluzione di esercizi.
Nella valutazione della prova e nell'attribuzione del voto finale si terrà conto del livello di conoscenza teorica degli argomenti e della capacità di applicare correttamente i concetti e le nozioni teoriche nella risoluzione degli esercizi.
La PROVA ORALE è facoltativa. Ogni studente che abbia superato la prova scritta (conseguendo un voto almeno pari a 18/30) può comunque sostenere la prova orale.

Testi adottati

TESTO DI RIFERIMENTO:
Cea D., Secondi L. Elementi di Statistica e Matematica. Per le scienze applicate. Libreria universitaria Edizioni, 2022

Di Pietro M, Milliani S, Secondi L., Esercizi e Applicazioni di Statistica e matematica. Libreria universitaria Edizioni, 2024

-Materiale didattico e esercitazioni messe a disposizione disponibili nel Portale dello studente.

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali (48 ore)
Esercitazioni (8 ore)

Modalità di frequenza

Il corso è strutturato in lezioni di didattica frontale ed esercitazioni, per le quali è fortemente raccomandata la frequenza da parte degli studenti. Le lezioni e le esercitazioni in aula consentiranno agli studenti di acquisire gli strumenti metodologici tipici del corso attraverso il riferimento ad applicazioni numeriche e applicate.

Bibliografia

• Abate M. (2017) Matematica e Statistica. Le basi per le scienze della vita. Mc-Graw Hill Education
• Anichini G., Conti G., Paoletti R. (2013) Algebra lineare e geometria analitica. Eserciziario. Pearson
• Anichini G., Conti G., Paoletti R. (2019) Algebra lineare e geometria analitica. Pearson
• Annaratone S. (2017) Matematica sul campo. Metodi ed esempi per le scienze della vita. Pearson
• Bigatti A.M., Robbiano L. (2014) Matematica di base. Casa Editrice Ambrosiana
• Biggeri, L., Bini, M., Coli, A., Grassini, L., Maltagliati, M. (2012). Statistica per le decisioni aziendali. Pearson
• Bodine E.N., Lenhart S, Gross L.J., (2017) Matematica per le scienze della vita. UTET università
• Bonino D, Crucinio F.R, Fontana R, Pellerey F (2017) Elementi di statistica per l’ingegneria e l’architettura. Società editrice Esculapio
• Borra S, Di Ciaccio A. (2008) Statistica. Metodologie per le scienze economiche e sociali. Mc-Graw Hill
• Bramanti M., Pagani C.D., Salsa S. (2008). Analisi Matematica I. Zanichelli
• Cicchitelli G., D’Urso P., Minozzo M. (2018) Statistica: principi e metodi. Pearson
• Cicchitelli, G. (2012) Statistica: principi e metodi. Pearson
• Guerraggio A. (2018) Matematica per le scienze. Pearson
• Hass J., Weir M.D., Thomas G.B. (2014) Analisi matematica 1. Pearson
• Leoni R. (1998) Introduzione alla statistica descrittiva. Libreria Alfani Editrice
• Leti G. (1983) Statistica descrittiva. Il Mulino
• Marucci A. (2016) Lezioni di matematica generale. Edizioni Sette Città
• Monti A.C. (2008) Introduzione alla statistica. Edizioni Scientifiche Italiane
• Piccolo D. (1998) Statistica. Il Mulino
• Stock J.H., Watson M.K. (2012) Introduzione all’econometria. Pearson
• Villani V., Gentili G. (2012). Matematica. Comprendere e interpretare fenomeni delle scienze della vita. McGrawHill (Quinta edizione).
• Whitlock M., Schulter D. (2022) Analisi statistica dei dati biologici. Zanichelli

16173 - BIOLOGIA ANIMALE

ROMOLO FOCHETTI

Primo Semestre 8BIO/05ita

Obiettivi formativi

L’insegnamento ha l’obiettivo principale di fornire tutte le nozioni di base per comprendere la correlazione tra morfologia, anatomia e funzione di organi e apparati in taxa invertebrati e vertebrati. Le principali conoscenze da acquisire riguarderanno: - elementi di base di tassonomia e classificazione; elementi di genetica di popolazione - teorie evolutive - i principali adattamenti degli animali in relazione all'ambiente di vita - la sistematica dei più importanti phyla animali. Le principali abilità (ossia la capacità di utilizzare le conoscenze acquisite) saranno: - l’utilizzo del microscopio ottico per la classificazione sistematica dei principali gruppi di invertebrati, nonché la valutazione sistematica di preparati di animali interi sotto formaldeide e la ricostruzione anatomica di animali attraverso modelli in plastica; - Collegare le differenze dell’organizzazione anatomo-fisiologica degli animali alle diverse nicchie ecologiche da questi occupate.
RISULTATI APPRENDIMENTO ATTESI
Nella valutazione dello studente si terrà conto del livello di conoscenza degli argomenti trattati, della capacità di analisi e di applicare le conoscenze acquisite nonché dell'autonomia di giudizio. Si terrà conto inoltre della capacità di sintesi, della padronanza di espressione e comunicazione e della capacità di effettuare collegamenti all'interno della disciplina o interdisciplinari.

Scheda Docente

Programma del corso

I regni dei viventi. Cellula procariote ed eucariote. La cellula animale: MEMBRANA PLASMATICA: struttura e funzioni. Sistema delle ENDOMEMBRANE: Reticolo endoplasmatico ruvido e ribosomi: Ruolo nella sintesi e maturazione delle proteine. Reticolo endoplasmatico liscio. Apparato di Golgi. Endocitosi ed esocitosi. Lisosomi. Basi del METABOLISMO. Glicolisi. Metabolismo aerobico: Mitocondri, Perossisomi. CITOSCHELETRO e motilità cellulare: Microfilamenti, Microtubuli, Filamenti intermedi. GIUNZIONI DI MEMBRANA: correlazione strutturale e funzionale con il citoscheletro. NUCLEO (cellule eucariotiche): Involucro nucleare, Lamina nucleare, Pori nucleari, Cromatina, Nucleolo. RIPRODUZIONE CELLULARE:Mitosi, Meiosi (1CFU) - Le basi genetiche della variabilità: mutazione, ricombinazione, selezione; -Micro e macroevoluzione. Origine ed evoluzione delle specie: speciazione e meccanismi di speciazione; - storia delle teorie evolutive - la genetica formale: le leggi di Mendel; - la genetica di popolazione: il pool genico, il teorema di Hardy-Weinberg, distribuzione e modificazione naturale e sperimentale della variabilità genetica, - struttura e funzione del corpo animale. L'organismo: riproduzione asessuata e sessuata, spermatogenesi, oogenesi e fecondazione, respirazione, circolazione, escrezione e regolazione osmotica, digestione, movimento, sistema nervoso e organi di senso, sviluppo embrionale, sviluppo diretto e indiretto, metamorfosi. - interpretazione dei genomi animali; meccanismi di adattamento fisiologico delle specie in relazione alle variabili chimico-fisiche; comportamento animale in relazione alla riproduzione e alle variabili ambientali. (3CFU) -Principali phyla animali (caratteristiche generali): Protisti. Poriferi. Celenterati. Platelminti. Nematodi. Rotiferi. Anellidi. Molluschi. Artropodi. Echinodermi. Cordati. (4CFU)

Modalità Esame

La prova orale si articola in genere su due domande, una di carattere generale e la seconda sulla sistematica e filogenesi dei phyla animali. Durante la prova orale vengono accertate le conoscenze in relazione al programma trattato, la capacità di analisi, la padronanza di espressione e l'acquisizione di un linguaggio specifico, relativo alla materia.

Testi adottati

- Manuale Zoologia. A cura di L. Ballarin. Piccin
- Solomon E.P., Berg L. R., Martin D.W. BIOLOGIA. (settima ediz.) Edises
-Russell P.J., Wolfe S.L., Hertz P.E., Starr C., McMillan B. BIOLOGIA (2010) Edises
-D. SADAVA, H. C. HELLER, G. H ORIANS, W. K PURVES, D. M. HILLIS. Biologia. Quarta edizione italiana. 2015 (event. anche solo voll. 2, 3, 5, 6)
- Raven P.H., Johnson G.B. Biologia. Piccin ed., 2012 (anche singoli volumi).
- Fondamenti di Zoologia. Hickman et al. MC Graw & Hill - Diversità animale. Hickman et al. Mc Graw & Hill
- Casiraghi M., de Eguileor M., Cerrano C., Puce S., 2023. Zoologia. UTET

Modalità di frequenza

La frequenza, pur altamente consigliata, non è obbligatoria.

Bibliografia

Invertebrati. R.C. Brusca e G. J. Brusca. 2003. Zanichelli, Bologna.

119537 - BIOLOGIA VEGETALE E PRINCIPI DI BIOTECNOLOGIE VEGETALI

ELISA OVIDI

Primo Semestre 8BIO/01ita

Obiettivi formativi

L'obiettivo di questo corso è quello di sviluppare le conoscenze e le capacità di comprensione della citologia, dell'anatomia e della morfologia delle piante. Queste conoscenze e competenze saranno applicate nella comprensione del meccanismo di funzionamento degli organismi vegetali in termini di attività fotosintetica, di trasporto dell'acqua e processi riproduttivi. Inoltre, lo studente svilupperà le competenze per conoscere il mondo delle piante che gli saranno poi utili nel proseguimento del suo corso di studi. In termini formativi lo studente sarà stimolato nel processo di apprendimento e svilupperà capacità indipendenti di valutazione, giudizio e di comunicazione.
L’obiettivo della parte del corso dedicata ai principi di biotecnologie vegetali è di sviluppare le conoscenze e le capacità di comprensione delle basi delle biotecnologie applicate alle piante. Tali conoscenze saranno strumento per la comprensione delle applicazioni del mondo vegetale, alla trasformazione e ottenimento di prodotti funzionali. L’autonomia di giudizio e la capacità di apprendere saranno l’obiettivo finale del corso, capacità che gli permetteranno anche di sviluppare le abilità comunicative necessarie al proseguimento del percorso formativo.

Scheda Docente

Programma del corso

Biologia vegetale:
Gli organismi vegetali
La nozione di organismo vegetale. La biodiversità. Piante e uomo: aspetti ecologici, economici e sociali
La cellula vegetale
La parete cellulare: biosintesi, struttura, composizione chimica e funzione.
La membrana citoplasmatica: struttura, composizione chimica e funzione.
Il nucleo ed il nucleolo. I plastidi. Il cloroplasto: aspetti strutturali e funzionali. La fotosintesi. Aspetti fisiologici del processo di fotosintesi. Il citoscheletro: i microtubuli, i microfilamenti, proteine associate strutturali e motori molecolari. Aspetti peculiari del processo di divisione cellulare: la banda preprofasica, il fuso mitotico, il fragmoplasto.
Piante: struttura e funzione
Tessuti vegetali. Tessuti meristematici primari e secondari. Tessuti fondamentali, di sostegno, tegumentali, di assorbimento, secretori e conduttori.
La radice: funzioni della radice, struttura primaria e secondaria, radici laterali e avventizie; assorbimento dell'acqua e sali minerali. Il trasporto della linfa grezza.
Il fusto: funzioni del fusto, struttura primaria nelle monocotiledoni e dicotiledoni; cambio cribro vascolare, struttura secondaria; sughero, fellogeno e felloderma.
La foglia: forma, struttura e funzione; epidermide, mesofillo, fasci conduttori; lo stoma: anatomia e meccanismo stomatico. Il trasporto della linfa elaborata.
Il fiore: il gineceo e l'androceo. L'impollinazione.
Il frutto: sviluppo dell'embrione; endosperma; sviluppo del frutto.
Il seme: aspetti strutturali; la disseminazione.

Principi di Biotecnologie Vegetali:
Cosa sono le Biotecnologie. Le vecchie Biotecnologie per la produzione di alimenti: le colture idroponiche, le colture cellulari vegetali. La Rivoluzione Verde degli anni '50-70 del secolo scorso.
Esempi di applicazioni attuali delle Biotecnologie Vegetali: Biotecnologie da piante trasformate e da piante non trasformate, le Biotecnologie Vegetali per miglioramento qualitativo degli alimenti, nuove applicazioni delle colture idroponiche, nuove applicazioni delle colture cellulari vegetali, le biomasse. La trasformazione delle piante, il Molecular Farming, piante vaccino, piante per la produzione di Biocarburanti e Bioplastica, molecole di origine vegetale per la produzione di farmaci. Considerazioni: Le Biotecnologie Vegetali ed il loro impatto sulla Società. Ricadute positive e negative in termini economici, occupazionali, ambientali e sanitari.

Modalità Esame

L'obiettivo della prova orale è verificare la capacità di apprendimento della materia, la capacità di saper ragionare sugli argomenti trattati nel Corso e la capacità di esposizione.
Per l’attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici, della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).

Testi adottati

Testi di riferimento per la Biologia Vegetale:
- Pasqua G., Abbate G., Forni C., Botanica Generale e Diversità Vegetale, Piccin Editore, Padova.
- Mauseth J.D., Botanica (parte generale), Idelson Gnocchi Editori, Napoli.
- Rost T.L., Barbour M.G., Stocking C.R., Murphy T.M., Biologia delle Piante, Zanichelli Editore, Bologna.

Testi di riferimento per Principi di Biotecnologie Vegetali:
- Tiezzi A., Biotecnologie Vegetali, il futuro che viene da lontano. Argomenti per una riflessione”. Casa Editrice Aracne, Roma, 2011.
- Tiezzi A. Dispensa "La Scienza ci dice....", 2022.
- Pasqua G., Forni C. Biotecnologie Vegetali, Piccin Editore, Padova.

Il Docente mette a disposizione tutte le diapositive ed i filmati mostrati durante il Corso.


Modalità di svolgimento

Il Corso si svolgerà in modalità tradizionale con lezioni in presenza (40 ore di Biologia vegetale per gli studenti dei corsi di Laurea L-2 e L-25 e 16 ore di Principi di Biotecnologie vegetali per gli studenti del corso di Laurea L-2). L'insegnamento consisterà di lezioni durante il quale il Docente esporrà gli argomenti riportati nel programma del Corso. Tutte le diapositive mostrate durante le lezioni saranno a disposizione degli studenti sulla piattaforma Moodle.
Saranno inoltre condotte lezioni in laboratorio (8 ore per entrambi i corsi di Laurea) allo scopo di far acquisire allo studente esperienze pratiche e di stimolare all'apprendimento della materia.

Modalità di frequenza

La frequenza alle lezioni è facoltativa. Il Docente auspica la presenza degli studenti, utile per migliorare la loro capacità di apprendimento

Bibliografia

Vedi testi

14963 - CHIMICA GENERALE E INORGANICA

FELICE GRANDINETTI

Secondo Semestre 8CHIM/03ITA

Obiettivi formativi

Con il presente insegnamento si intende fornire agli studenti i concetti generali relativi agli aspetti chimici della catalisi e alle sue applicazioni in campo biologico e biotecnologico. Partendo dagli aspetti fondamentali della cinetica chimica, si svilupperà un percorso che dovrà al suo esito mettere in grado lo studente di discutere il meccanismo di reazione di alcuni processi di interesse biotecnologico, individuando l'eventuale natura catalitica degli stessi e discutendone in maniera critica le varie fasi e le possibili applicazioni industriali.
Conoscenza e capacità di comprensione: acquisizione da parte dello studente di contenuti specifici relativamente a: i) principi generali della cinetica chimica e della catalisi; ii) individuazione di processi catalici di interesse biotecnologico, con descrizione dettagliata delle varie fasi; iii) collocazione dei sistemi studiati nell'ambito più generale della catalisi e biocatalisi industriale. 2) Capacità di applicare conoscenza e comprensione: verrà curata la capacità dello studente di analizzare, alla luce delle conoscenze acquisite, il possibile interesse, anche su larga scala, di un processo di natura catalitica, sia naturale che di sintesi, esaminandone criticamente le varie fasi e gli eventuali obiettivi applicativi. 3) Autonomia di giudizio; l’insegnamento dovrà fornire allo studente la capacità di lavorare in autonomia di giudizio anche attraverso la consultazione critica e la comparazione di materiali didattici di varia tipologia. Si svilupperà inoltre in ogni caso la capacità del singolo di interagire criticamente con gli altri componenti di una classe omogenea, stimolando in particolare l'interazione fra i componenti della stessa. 4) Abilità comunicative: lo studente che frequenta l’insegnamento verrà continuamente sollecitato ad illustrare, anche mediante tecniche audiovisive, i progressi fatti nello studio della disciplina e nell'apprendimento dei concetti presentati. Il docente stimolerà inoltre la discussione anche mediante uno scambio di opinioni tra gli studenti frequentanti, che diventeranno così parte attiva nel processo di comunicazione e di elaborazione del singolo. 5) Capacità di apprendere: verrà costantemente stimolata anche attraverso la somministrazione di test e di esercizi da svolgere in maniera autonoma, con l'obiettivo di restituirne i risultati e di confrontarli con quelli ottenuti dagli studenti che frequentano la stessa classe. Verranno inoltre svolti esercizi in classe e simulazioni della prova finale.

Scheda Docente

Programma del corso

Concetti introduttivi. Stati di aggregazione della materia. Sistemi omogenei ed eterogenei. Sostanze ed elementi chimici. Teoria atomica della materia. Proprietà atomiche: massa e dimensioni. Scala dei pesi atomici. Numero di Avogadro, concetto di mole. Simboli chimici e loro significato quantitativo. Struttura dell' atomo: Modello di Bohr. Principio di indeterminazione. Natura ondulatoria dell'elettrone. Equazione di Schrodinger. Orbitali atomici. Numeri quantici. Configurazione elettronica degli elementi. Regole dell Aufbau. Il sistema periodico degli elementi. Proprietà periodiche. Il legame chimico: Legame ionico, covalente e di coordinazione. Proprietà del legame: ordine, distanza ed energia. Elettronegatività e momento dipolare. Teoria del legame chimico: orbitali ibridi, risonanza e mesomeria. Proprietà magnetiche delle molecole. Legami intermolecolari. Legame a idrogeno. Formule chimiche. Nomenclatura dei composti inorganici. Numero di ossidazione. Struttura di molecole e ioni tipici. Lo stato gassoso: Leggi dei gas. Equazione di stato per i gas ideali. Gas reali (cenni). Lo stato solido: Strutture cristalline e loro simmetrie. Solidi molecolari, ionici, covalenti e metallici. Termodinamica chimica: Calore e lavoro. Primo principio della termodinamica. Entalpia e legge di Hess. Entropia. Secondo principio della termodinamica. Energia libera. Terzo principio della termodinamica. Equilibrio chimico: Criteri di spontaneità ed equilibrio nelle reazioni chimiche. Legge di azione di massa e sua derivazione. Isoterma ed isocora di van't Hoff. Equilibri omogenei ed eterogenei. Soluzioni: Concentrazione e sue unità di misura. Proprietà colligative delle soluzioni ideali. Equilibri acido-base: Definizioni generali. Forza degli acidi e delle basi. Struttura e proprietà acido-base. Autoionizzazione dell' acqua. Il pH. Calcolo del pH di soluzioni di acidi, di basi e di sali. Soluzioni tampone. Titolazioni acido-base e curve di titolazione. Equilibri di solubilità: Solubilità e fattori che la influenzano. Prodotto di solubilità. Effetto dello ione a comune. Cinetica chimica: Velocità di reazione. Equazione di Arrhenius. Energia di attivazione. Catalisi. Elementi di chimica inorganica: Composti inorganici di interesse biologico ed ambientale: ossigeno ed ozono, ossidi dell'azoto, ossidi dello zolfo, composti del fluoro e del cloro. Il Corso prevede lo svolgimento di calcoli stechiometrici relativi agli argomenti teorici sopra elencati.

Modalità Esame

L'esame prevede lo svolgimento di una prova scritta, riguardante gli esercizi di stechiometria, e di una prova orale, che serve a valutare le conoscenze generali acquisite dallo studente, in particolare gli aspetti fondamentali della disciplina. La prova scritta può essere svolta in un'unica soluzione, oppure attraverso due valutazioni in itinere, la prima delle quali propedeutica alla seconda.

Testi adottati

1) AA.VV. Le basi della Chimica, EDIZIONI A.L.E. 2022
2) AA. VV. Stechiometria, EDIZIONI A.L.E. 2021
3) Dispense dal materiale utilizzato a lezione
4) Raccolta di esercizi d'esame

Modalità di svolgimento

Il corso viene erogato attraverso lezioni frontali basate anche sulla proiezione di slights e sull'illustrazione analitica di esercizi numerici svolti alla lavagna.

Modalità di frequenza

Consigliata ma non obbligatoria

Bibliografia

1) M. Casarin, L. Casella, R. d'Agostino, A. Filippi, F. Grandinetti, R. Purrello, N. Re, M. Speranza, Chimica Generale e Inorganica, Edi-Ermes, Milano.
2) F. Cacace, M. Schiavello, Stechiometria, Bulzoni

15038 - IDONEITA' LINGUA INGLESE

MARIA DE JULIAN GARCIA

Secondo Semestre 6L-LIN/12ITA

Obiettivi formativi

Corso "BIOTECHNOLOGY- Level B1 DIBAF" 2021-22

Obiettivi formativi
Gli obiettivi didattici minimi del corso sono finalizzati a permettere allo studente/alla studentessa di leggere e comprendere (reading-comprehension) efficacemente testi in inglese quali brevi articoli scientifici e/o divulgativi, capitoli di libri, ect.. Obiettivo secondario é lo sviluppo dell'abilità di ascolto di brevi testi audio/video sulle medesime tematiche.
Gli obiettivi formativi includono inoltre:
i. l'analisi grammaticale e stilistica dei testi;
ii. l'apprendimento lessicale, e sono finalizzati al superamento dell'accertamento finale/esame di profitto.

Risultati di apprendimento attesi
1) Conoscenze e capacità di comprensione
Lo studente/la studentessa dovrà dimostrare di avere acquisito un grado di conoscenza e di comprensione di contenuti linguistici (lettura, comprensione ed analisi di testi scientifici) almeno di livello B1-B1+.
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
Lo studente/la studentessa dovrà dimostrare di saper applicare la conoscenza acquisita e la comprensione dei contenuti didattici erogati attraverso il superamento con sicurezza della prova d'accertamento finale
3) Autonomia di giudizio
Lo studente/la studentessa dovrà dimostrare di saper analizzare in modo critico ed in autonomia il materiale didattico disponibile, e di proporre anche attività di autoapprendimento in autonomia.
4) Abilità comunicative
Durante la frequenza del corso/laboratorio gli studenti/le studentesse dovranno dimostrare anche sufficienti abilità comunicative orali in lingua inglese.
5) Capacità di apprendere
Lo studente/la studentessa dovrà dimostrare una capacità di apprendere i contenuti didattici di un livello almeno pari a B1-B1+.

Scheda Docente

Programma del corso

Unità 1: Formazione e coniugazione delle frasi. - Guida alla creazione e coniugazione delle frasi in lingua inglese.
Unità 2: Introduzioni & Informazioni Personali. Vocabolario: famiglia, professioni, hobby. Grammatica: Present Simple, domande e risposte, preposizioni di luogo.
Unità 3: Routine Quotidiane & Orari. Vocabolario: routine quotidiane, orari, attività giornaliere. Grammatica: Adverbs of frequency, domande con "how often”. Scrittura: brevi paragrafi.
Unità 4: Lavoro & Studio. Vocabolario: professioni, studi, lavori ideali. Grammatica: Modal verbs (can, could, must, should) per obblighi e capacità.
Unità 5: Vacanze & Viaggi. Vocabolario: destinazioni turistiche, trasporti, attività in vacanza. Grammatica: Past Simple e l'uso di "went," “visited". Scrittura: Eventi passati.
Unità 6: Salute & Benessere. Vocabolario: malattie, parti del corpo, abitudini salutari. Grammatica: Imperatives per dare consigli, should/shouldn't.
Unità 7: Cibo & Bevande. Vocabolario: cibi, bevande, ingredienti. Grammatica: Countable and uncountable nouns, some/any, how much/how many.
Unità 8: Shopping & Moda. Vocabolario: abbigliamento, negozi, confronto prezzi. Grammatica: Comparatives and superlatives, "like" e "as".
Unità 9: Tecnologia & Comunicazione. Vocabolario: dispositivi elettronici, social media, applicazioni. Grammatica: Present Continuous (per piani futuri), future simple per previsioni. Scrittura: email formali e informali.
Unità 10: Ambiente. Vocabolario: ambiente, problemi ecologici, energie rinnovabili. Grammatica: Conditional sentences (tipo 0 e 1).
Unità 11: Il Passato & Eventi Storici. Vocabolario: eventi storici, date importanti, ricordi. Grammatica: Past Continuous vs Past Simple, used to.
Unità 12: Opinioni & Preferenze. Vocabolario: gusti, opinioni, preferenze. Grammatica: Expressing opinions, would rather, prefer to. Scrittura: saggio di opinione.
Unità 13: Relazioni & Socializzazione. Vocabolario: relazioni interpersonali, amicizia, famiglia. Grammatica: Relative clauses, "who," "which," "that".
Unità 14: Casa & Alloggio. Vocabolario: tipi di abitazioni, caratteristiche di una casa. Grammatica: Prepositions of place, there is/there are.
Unità 15: Cultura & Intrattenimento. Vocabolario: cinema, musica, teatro, eventi culturali. Grammatica: Reported speech, indirect questions. Scrittura: articoli.
Unità 16: Piani Futuri & Ambizioni. Vocabolario: piani futuri, sogni, obiettivi. Grammatica: Future forms (will, going to, present continuous for future).
Unità 17: Ripasso & Revisione. Ripasso di tutti gli argomenti trattati nel corso. Attività di consolidamento e pratica.

* Il programma è soggetto a modifiche in base alle esigenze didattiche degli studenti.

Modalità Esame

L'esame consisterà in due parti (potrai accedere alla parte 2 - orale - solo superando la parte 1):

Parte scritta:

Grammatica B1 + Use of English + comprensione scritta
Scrittura – Tra quelle viste in classe.

Parte orale:
Una conversazione.
1 argomento, spiegarlo in inglese.

Testi adottati

Materiale fornito dal docente è presente in unitus Moodle.

Modalità di frequenza

Non obbligatoria, ma altamente consigliata.

Bibliografia


Libro di grammatica:

•Jon Hird (2021), The complete English grammar for Italian students.


Dizionario:

• Oxford Leraner’s Dictionary:https://www.oxfordlearnersdictionaries.com/


Letture (a scelta una per l'esame):

Skloot, R. (2010). The immortal life of Henrietta Lacks. Broadway Books.
Shelley, M. (1818/2009). Frankenstein (Simplified edition). Penguin Readers.
Kamkwamba, W., & Mealer, B. (2015). The boy who harnessed the wind (Young readers edition). Puffin Books.
Watson, J. D. (1968/2012). The double helix (Adapted edition). Simon & Schuster.
Fossey, D. (1983). Gorillas in the mist. Houghton Mifflin Harcourt.

15613 - DIRITTO EUROPEO DELLE BIOTECNOLOGIE

MARIA PIA RAGIONIERI

Secondo Semestre 6IUS/14ITA

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

18424 - FISICA

BRUNO OLIVIERI

Secondo Semestre 7FIS/07ITA

Obiettivi formativi

Conoscenza e capacità di comprensione:

Al termine del corso, gli studenti dovranno dimostrare di aver acquisito:
• La conoscenza dei principi fondamentali della fisica classica (meccanica, termodinamica, elettromagnetismo) e moderna, con particolare riferimento ai fenomeni rilevanti per i sistemi biologici.
• La capacità di comprendere come le leggi della fisica si applicano ai processi biochimici e biologici.
• Conoscenza e capacità di comprensione applicate:
• Gli studenti dovranno essere in grado di:
• Applicare i concetti fisici per risolvere problemi quantitativi relativi a fenomeni biologici e biotecnologici.
• Utilizzare strumenti matematici e modelli fisici per analizzare dati sperimentali.
• Interpretare il funzionamento di tecnologie biotecnologiche basate su principi fisici, come spettroscopia, microscopia e risonanza magnetica.
Autonomia di giudizio:

Essere in grado di:
• Valutare in modo critico l'applicabilità dei principi fisici ai problemi biotecnologici.
• Analizzare dati sperimentali e trarre conclusioni basate su evidenze scientifiche.
Abilità comunicative:

Gli studenti dovranno aver sviluppato la capacità di:
• Comunicare in modo chiaro e rigoroso concetti e risultati fisici, utilizzando un linguaggio tecnico appropriato.
• Collaborare efficacemente in contesti interdisciplinari per affrontare problemi complessi.
Capacità di apprendere:
• Essere in grado di apprendere autonomamente nuovi concetti e metodologie fisiche, aggiornandosi costantemente in funzione delle evoluzioni del settore biotecnologico.







Scheda Docente

Programma del corso

FISICA per Biotecnologie

Programma dettagliato a.a 2024-2025

- Per ogni argomento sono indicati i paragrafi del libro di testo: Fisica, Giancoli – Ed. Ambrosiana
- La parti sottolineate riguardano gli argomenti riguardanti gli esercizi



1. Modelli, teorie, leggi, misure e incertezze. Unità di misura (Sistema Internazionale)

1.4-Misure e incertezze. Cifre significative
1.5-Unità di misura. Sistema internazionale
1.6-Conversione unità di misura
1.7-Stime per ordine di grandezza
1.8-Analisi dimensionale


2. I vettori
3.2, 3, 3 – operazioni tra vettori
3.4 – scomposizione di vettori ed operazioni per componenti

3. Definizione di vettore posizione, velocità ed accelerazione
2.2, 2.3, 2.4, 2.5, 2.6, 2.7 - Moto rettilineo – uniforme ed uniformemente accelerato – caduta libera

4. Dinamica
Le 3 leggi della dinamica
4.4 Definizione di forza e IIa legge della dinamica, la massa inerziale.
4.5 Legge di azione e reazione
4.6, 4.7, 4.8 Applicazioni e forze di attrito

Moti periodici
8.1 Grandezze lineari e grandezze angolari
5.1, 5.2 Forza centripeta: Moto circolare uniforme
11.1, 11.2, 11.3 Legge di Hooke: Moto armonico
11.4 Il pendolo semplice

5. Energia
6.2, 6.3 Lavoro. Energia cinetica,
6.10 Potenza
6.4, 6.5, 6.6, 6.7, 6.8, 6.9 Forze conservative. Energia Potenziale. Conservazione dell’energia meccanica.

6. Urti e Quantità di moto
7.1 – 7.7 Urti elastici e anelastici, conservazione della quantità di moto

7. Dinamica rotazionale
8.2, 9.1, 9.2 Momento di una forza
8.3 Inerzia di rotazione
8.4 Energia cinetica di rotazione
8.5 Momento angolare e sua conservazione




8. Fluidi
10.3, 10.4 Pressione, legge di Stevino
10.5 Principio di Pascal
10.7 Principio di Archimede
10.8 Fluidi in movimento
10.9, 10.10 Equazione di Bernoulli
10.13 Tensione superficiale e capillarità

9. Onde
11.6 Moto ondulatorio e propagazione delle onde meccaniche
11.7 caratteristiche delle onde
11.8 energia trasportata dalle onde
11.9 Riflessione ed interferenza delle onde
11.10, 11.11 Sovrapposizione di onde e onde stazionarie
11.12 Rifrazione della luce
12.1, 12.2, 12.3 Il suono e sue caratteristiche

10. Temperatura ed energia cinetica
13.2 Scale termometriche
13.3 Principio zero della termodinamica
13.4 Dilatazione termica
13.5 Legge dei gas e temperatura assoluta
13.6, 13.7 legge dei gas perfetti
13.9 teoria cinetica dei gas

11. Il calore
14.1 Il calore come trasferimento di energia
14.2 Energia interna
14.3, 14.4 Calore specifico
14.5 Cambiamenti di stato e calore latente
14.6, 14.7, 14.8 trasmissione del calore


12. Termodinamica
15.1 Primo principio della termodinamica
15.2 Trasformazioni termodinamiche
15.4 secondo principio della termodinamica
15.5 macchine termiche
15.7, 15.8, 15.9 Entropia
15.10 Interpretazione statistica dell’entropia (cenni)

13. Campo elettrico
16.2, 16.3, 16.4 Cariche elettriche e struttura dell’atomo
16.5 interazione tra cariche elettriche, legge di Coulomb
17.1, 17.2, 17.3, 17.4, 17.5, 17.6 Energia potenziale elettrica, potenziale elettrico e campo elettrico
17.7 Capacità elettrica, energia associata ad un campo elettrico
17.8 Dielettrici (cenni)

14. La corrente elettrica
18.2 Correnti elettriche
18.3, 18.4 Leggi di Ohm
18.5 Effetto Joule
19.1 fem
19.2 resistenze in serie e parallelo


15. Campo magnetico
20.1, 20.2, 20.5, 20.6, 20.7 Origine e caratteristiche del campo magnetico
20.3, 20.4 Forza di Lorentz
10.10 Spettrometro di massa e selettore di velocità
20.9 momento di dipolo magnetico e sua interazione col campo magnetico

16. Induzione elettromagnetica e leggi di Faraday
21.1, 21.2, 21.3 fem indotta: legge di Faraday Neumann e legge di Lenz
21.4 campi elettrici e magnetici variabili nel tempo
21.6 Trasformatori
Proprietà magnetiche della materia (cenni)


17. Onde elettromagnetiche e loro spettro
22.1 Equazioni di Maxwell (significato fisico)
22.2, 22.3 onde em e spettro
22.5 energia del campo em

18. La luce: ottica geometrica
23.1, 23.2, 23.3, 23.4, 23.5 Riflessione e rifrazione della luce
23.6, 23.7, 25.3, 25.5 lenti sottili e strumenti ottici

19. Natura ondulatoria della luce
24.1 Onde e particelle
24.2, 24.5 interferenza, diffrazione, principio di Huygens
24.3 doppia fenditura
24.6 Reticoli di diffrazione
24.7 cenni di spettroscopia

20. Meccanica quantistica
27.2 radiazione di corpo nero
27.3 Effetto fotoelettrico
27.4 Energia, massa e quantità di moto di un fotone
27.7, 27.8, 27.13 dualismo onda-particella, lunghezza d’onda di de Broglie
27.10, 27.11, 27.12 Modelli atomici: Thomson, Rutherford, Bohr
28.3 Principio di indeterminazione di Heisenberg

21. Radioattività
30.1 Struttura e proprietà del nucleo
30.2 Energia di legame e forze nucleari
30.3, 30.4, 30.5, 30.6 Radioattività: alfa, beta, gamma
30.8, 30.9 Decadimento radioattivo

Modalità Esame

Prova scritta unica articolata su sei quesiti. Per ogni quesito sarà dato un punteggio da zero a cinque. L'esame si intende superato se si ottiene almeno 18/30.

Testi adottati

Douglas C. Giancoli
Fisica con fisica moderna
Terza edizione
Editore Ambrosiana Zanichelli

Modalità di frequenza

Si consiglia vivamente di frequentare tutte le lezioni in presenza e quelle eventuali online, al fine di ottenere il massimo profitto dal corso

15790 - TIROCINIO

Secondo Semestre 8ita
INSEGNAMENTOSEMESTRECFUSSDLINGUA
13719 - CHIMICA ORGANICA

LORENZO BOTTA

Primo Semestre 7CHIM/06ITA

Obiettivi formativi

OBIETTIVI FORMATIVI

Il corso introduce ai concetti ed agli approcci sperimentali della chimica organica, operando il consolidamento di principi acquisiti nell’ambito dei corsi di fisica e di chimica generale ed inorganica per procedere alla conoscenza della chimica del carbonio. Saranno fornite, nella prima parte del corso, le basi culturali e pratiche per la comprensione della struttura delle molecole organiche, ponendo una particolare attenzione alle relazioni esistenti tra la struttura chimica e le proprietà chimico-fisiche e biologiche ad esse associate. I diversi stati fisici di ibridazione del carbonio permetteranno la visione tridimensionale delle molecole, facilitando la comprensione del loro ruolo nella cellula. La seconda parte del corso è dedicata alla applicazione delle proprietà nel contesto della reattività chimica. Lo studente avrà la possibilità di avere le risposte per alcune tra le domande fondamentali nel suo percorso di studi: perché le molecole reagiscono? Quali sono i fattori sperimentali che controllano la cinetica delle reazioni? Quando una reazione è sotto controllo termodinamico piuttosto che cinetico? Come è possibile sintetizzare molecole complesse a partire da semplici reagenti? Quale è l’impatto della chimica organica sull’ambiente e come è possibile ridurlo? Queste conoscenze permetteranno allo studente di affrontare i corsi di studio successivi con una forte competenza strutturale e molecolare.

RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI

• Conoscenza e capacità di comprensione (knowledge and understanding): Conoscenza dei principi che regolano la formazione del legame chimico, attraverso l’impiego di teorie tradizionali (teoria del legame di valenza) e avanzate (teoria dell’orbitale molecolare e cenni di meccanica quantistica). Conoscenza della nomencletura e della classificazione (teoria dei gruppi funzionali) delle molecole organiche, con una particolare attenzione alla associazione tra famiglia di molecole organiche e proprietà biologiche e chimico-fisiche. Conoscenza della reattività delle molecole organiche e dei parametri sperimentali in grado di controllare la termodinamica e la cinetica delle trasformazioni organiche. Conoscenza della relazione tra le molecole organiche e l’origine della vita.
• Conoscenza e capacità di comprensione applicate (applying knowledge and understanding): In aggiunta alle conoscenze acquisite attraverso lo studio della chimica organica, gli studenti potranno applicare i concetti acquisiti per la risoluzione di esercizi pratici inerenti l’identificazione e la classificazione delle sostanze in base alla loro attività sull’organismo, l’effetto della chiralità sull’attivita farmacologica, la possibilità di separare sostanze organiche isomere e le metodologie generali per la loro analisi e per il loro riconoscimento.
• Autonomia di giudizio (making judgements): Il corso offre collegamenti con altre discipline del percorso di Laurea (fisica, chimica generale, biochimica, biologia molecolare, chimica computazionale e genetica) fornendo una conoscenza integrata. Il giudizio critico dello studente sarà stimolato facendo continuo riferimento alla lettura di studi recenti pubblicati in riviste scientifiche del settore, ponendo in discussione le problematiche attuali relative ad alcuni dei concetti fondamentali della disciplina. Grazie alla natura multi- ed interdisciplinare della chimica organica, sarà inoltre possibile collegare le nozioni acquisite alle problematiche di altre discipline, permettendo allo studente la formazione di una propria autonomia di giudizio circa l’efficacia di un approccio scientifico integrato.
• Abilità comunicative (communication skills): Al termine di ogni parte essenziale del corso gli studenti saranno invitati a formare dei gruppi di lavoro per sviluppare soluzioni e competere con gli altri nella risoluzione di esercizi pratici. Lo strumento didattico è volto a far crescere le capacità comunicative e l’abilità di sapere lavorare in un gruppo, il tutto finalizzato al consolidamento dei concetti acquisiti.
• Capacità di apprendere (learning skills): le capacità di apprendimento degli studenti saranno valutate durante lo svolgimento del corso tramite prove di esonero che permetteranno di seguire individualmente lo stato di maturazione della conoscenza, evidenziando le capacità di restituzione dello studente.

Scheda Docente

Programma del corso

Alcani e cicloalcani. Introduzione. Struttura. Ibridazione sp3. Nomenclatura. Proprietà fisiche. Isomeria di struttura. Analisi conformazionale (etano, cicloesano). Stabilità dei cicloalcani (tensione angolare, tensione torsionale, tensione sterica). Derivati del cicloesano (stereoisomeria cis-trans). Alcani biciclici e policiclici. Ruolo naturale ed applicazioni degli alcani.

Alcheni. Introduzione. Struttura. Ibridazione sp2. Nomenclatura. Proprietà fisiche. Stabilità (calore di idrogenazione, calore di combustione). Sistema di nomenclatura (E)-(Z) per gli alcheni. Cicloalcheni.Funzione biologica.

Alchini. Introduzione. Struttura. Ibridazione sp. Nomenclatura. Proprietà fisiche.

Gruppi funzionali e classi di composti organici. Alogenuri alchilici. Alcoli. Eteri. Ammine. Aldeidi e chetoni. Acidi carbossilici. Esteri ed ammidi. Introduzione. Struttura. Nomenclatura. Proprietà fisiche.

Stereochimica. Introduzione. Chiralità del carbonio. Enantiomeri e molecole chirali. Rappresentazione grafica. Nomenclatura (R) (S). Attività ottica (potere rotatorio specifico, definizione di racemo, purezza ottica). Diastereoisomeri (composti meso).

Composti aromatici. Introduzione. Benzene. Struttura e stabilità. Regola di Huckel. Altri composti aromatici. Nomenclatura dei derivati del benzene. Fenomeni di induzione e di risonanza. Composti aromatici eterociclici. I composti aromatici in biochimica.

Carboidrati. Classificazione. Monosaccaridi. Mutarotazione e formazione dei glucosidi. Configurazione D o L. Disaccaridi. Polisaccaridi.

Proteine. Struttura degli amminoacidi. Nomenclatura. Legame peptidico. Oligopeptidi.

Acidi nucleici. Basi nucleiche puriniche e pirimidiniche. Nucleosidi. Nucleotidi. Oligonucleotidi.

Lipidi.

Modulo B. LA REATTIVITA'

Reazioni di alcani e cicloalcani. Clorurazione del metano. Radicali liberi. Stabilità e struttura. Termodinamica e cinetica. Alogenazione degli alcani superiori.

Reazioni di sostituzione nucleofila. Reazione SN2. Reazione SN1. Meccanismi ed andamenti stereochimici. Effetti del solvente e del gruppo uscente. Reazioni di eliminazione. Reazione E1. Reazione E2. Competizione tra sostituzione ed eliminazione.

Reazioni dei composti aromatici. Sostituzione elettrofila aromatica. Meccanismo. Alogenazione del benzene. Effetto dei sostituenti.

Modalità Esame

VALUTAZIONE DEL PROFITTO

L'esame finale è una prova scritta seguita da un esame orale. La prova finale verte sull'ultima edizione del programma di chimica organica. L’esame scritto è costituito da due domande teoriche e da tre problemi relativi agli argomenti del corso. Le domande sono costruite per verificare la capacità di conoscenza e il collegamento tra i contenuti del corso. L’esame orale consiste nella revisione del compito scritto e nell’approfondimento di alcuni dei suoi contenuti. Il voto finale corrisponde alla media delle due prove.

DESCRIZIONE DEI METODI DI ACCERTAMENTO

L'esame si svolge nelle forme stabilite dal Regolamento Didattico di Ateneo. Il voto è espresso in trentesimi, con eventuale lode. Il superamento dell'esame presuppone il conferimento di un voto non inferiore ai diciotto/trentesimi e comporta l'attribuzione dei corrispondenti crediti formativi universitari. Nella valutazione delle prova e nell’attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (errori nell’applicare i concetti, discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta). In particolare, le domande avranno come obiettivo la verifica degli obiettivi di apprendimento: Conoscenza delle teorie che interpretano la formazione dei legami chimici, applicazione di tali teorie per la costruzione delle molecole organiche, classificazione delle molecole organiche in base alla loro struttura, proprietà chimico-fisiche e reattività. Il calendario degli appelli e l'iscrizione agli appelli di esame vengono fatti tramite il portale di Ateneo.

Testi adottati

Chimica Organica Essenziale, Bruno Botta, EdiTes

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali in aula supportate da esercitazioni pratiche nella risoluzione di problemi attinenti i contenuti della lezione. Per le attività di didattica frontale sono previsti 7 CFU.

Modalità di frequenza

La frequenza al corso, sebbene altamente consigliata, è facoltativa

15607 - MICROBIOLOGIA E PRINCIPI DI MICROBIOLOGIA INDUSTRIALE

MAURIZIO PETRUCCIOLI

Primo Semestre 9BIO/19ITA

Obiettivi formativi

A) OBIETTIVI FORMATIVI
Fornire agli studenti conoscenze fondamentali del mondo dei microrganismi (procarioti in particolare) quali struttura e funzione (citologia e fisiologia) e genetica della cellula procariote, sviluppo e conseguente crescita delle popolazioni. Lo studente, inoltre, dovrà acquisire una visione generale dell'impatto dei microrganismi in natura (cicli biogeochimici, p. es.) e delle loro potenzialità applicative a livello industriale e ambientale. Verranno inoltre fornite alcune conoscenze di base di virologia. E' scopo del corso anche quello di far prendere agli studenti confidenza con alcune tecniche di base del laboratorio di Microbiologia.

B) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI
1) Conoscenza e capacità di comprensione (knowledge and understanding)
L’insegnamento contribuirà a far acquisire conoscenze e capacità di comprendere e descrivere le strutture ed i processi biologici fondamentali nell'ambito della microbiologia. Si mira, inoltre, a far acquisire conoscenze teorico-sperimentali della microbiologia relativamente ad aspetti cellulari, morfologici, biochimici, fisiologici e genetici. Tutte queste informazioni consentiranno allo studente di comprendere sia gli elementi fondamentali della microbiologia sia quelli interdisciplinari.
2) Capacità di applicare conoscenza e comprensione (applying knowledge and understanding)
Lo studente sarà in grado di tradurre sul piano pratico le conoscenze teoriche e di argomentare problematiche nell’ambito della microbiologia generale e soprattutto industriale e ambientale. Attraverso le attività di laboratorio, gli studenti acquisiranno la capacità di applicare sul piano pratico le conoscenze teoriche attuando tecniche di base tipiche del laboratorio di microbiologia.
3) Autonomia di giudizio (making judgements);
Lo studente avrà la capacità di interpretare in modo autonomo sia le conoscenze di base che applicate della microbiologia. Questa capacità verrà acquisita, in particolar modo, grazie alla frequenza di attività pratiche ed esercitazioni in aula e laboratorio.
4) Per le abilità comunicative (communication skills)
Lo studente che frequenta l’insegnamento sarà in grado di presentare, anche con l'ausilio delle opportune tecniche audiovisive ed in modo critico, le conoscenze connesse con la microbiologia generale e applicata. Tale abilità saranno conseguite anche grazie all’ampio uso che viene fatto delle presentazioni power point in aula e al dialogo e scambio di opinioni tra gli studenti ed il docente sia in occasione delle lezioni frontali che durante le attività di laboratorio.
5) La capacità di apprendere (learning skills)
Gli studenti comprenderanno e acquisiranno i metodi di indagine e di lavoro in ambito microbiologico. Saranno, quindi, in grado di approfondire autonomamente le conoscenze e competenze acquisite. Tale abilità verrà sviluppata mediante il coinvolgimento attivo degli studenti attraverso discussioni orali in aula su temi specifici dell’insegnamento e nelle attività di laboratorio.

Scheda Docente

Programma del corso

Il corso si svolgera’ secondo la seguente articolazione:
1. Storia della Microbiologia (cenni): la scoperta del mondo dei microrganismi; la controversia sulla generazione spontanea; i microrganismi come agenti di malattia e loro ruolo nella trasformazione della sostanza organica.
2. Basi tecniche del laboratorio di microbiologia: il microscopio, richiami di fisica ottica; preparati a fresco e colorati; microscopia elettronica (a trasmissione ed a scansione), cenni; la coltura pura ed il suo ottenimento; principi generali di nutrizione microbica; preparazione dei terreni colturali; teoria e pratica della sterilizzazione; controlli di sterilità.
3. Citologia della cellula procariota ed eucariota: generalità; struttura ed ultrastruttura della cellula batterica; struttura e funzione della membrana; sistemi di trasporto attraverso la membrana; la parete cellulare, composizione chimica e caratteristiche; la parete dei batteri Gram+ e Gram-; la parete degli archebatteri e degli eucarioti; la capsula e la virulenza ad essa legata; il movimento e gli organi di movimento; la chemiotassi; la endospora batterica, struttura, funzione ed importanza; cenni alle spore degli eucarioti ed alla alternanza di generazione; il mitocondrio e la funzione respiratoria; cenni all'arrangiamento del DNA ed alla divisione cellulare.
4. Fisiologia cellulare: richiami di chimica e biochimica cellulare (energia di attivazione; catalisi ed enzimi; le reazioni biologiche di ossidoriduzione; trasportatori di idrogeno e di elettroni; i composti fosfato con legami ricchi di energia); produzione di energia nei sistemi biologici; la glicolisi e le vie simili; riossidazione del NAD ridotto: fermentazione e respirazione; la fermentazione alcolica e lattica; la respirazione aerobica; il ciclo degli acidi tricarbossilici; il sistema di trasporto degli elettroni; bilancio energetico della respirazione; cenni alla respirazione anaerobica; biosintesi e ricambio del materiale cellulare.
5. Sviluppo microbico: crescita di una singola cellula e di una popolazione microbica; misura dello sviluppo e curva di crescita; repressione catabolica e diauxia; effetto delle condizioni colturali sullo sviluppo microbico.
6. Principi di genetica molecolare e genetica batterica: richiami alla struttura del DNA; azione degli enzimi di restrizione; replicazione del DNA; elementi genetici; riarrangiamento dei geni; trasposoni; il processo di trascrizione; struttura e funzione di mRNA e tRNA; il processo di traduzione e la sintesi proteica; il codice genetico; agenti mutageni e mutazioni; la ricombinazione nei batteri; trasformazione, trasduzione e coniugazione; plasmidi e loro significato biologico.
7. Virologia: natura della particella virale; conte virali; caratteristiche generali della riproduzione virale; principi di genetica dei virus; batteriofagi a RNA; batteriofagi icosaedrici a singolo filamento di DNA; virus DNA a doppio filamento; i virus batterici temperati e la lisogenia; le principali famiglie di virus animali (cenni).
8. Ecologia microbica: richiami alle tecniche di isolamento ed identificazione dei microrganismi; interazioni tra popolazioni microbiche e con altri organismi; comunita’ microbiche ed ecosistemi; i principali cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ferro, ecc.); ruolo dei microrganismi nella decontaminazione ambientale; catabolismo aerobio o anaerobio di inquinanti organici e trattamento delle acque reflue.
9. Biotecnologie microbiche: i microrganismi di interesse industriale; screening da ambienti naturali e da collezioni; il fermentatore, geometria ed impieghi; il processo di scale-up; metaboliti primari e secondari; cenni su produzione di antibiotici, di enzimi, aminoacidi e sulla immobilizzazione.

Le esercitazioni di laboratorio riguarderanno i seguenti argomenti:
1. Microscopia e osservazioni microscopiche; osservazioni a fresco; colorazioni semplici e differenziali e osservazioni di preparati colorati;
2. Terreini di coltura: preparazione di terrini liquidi e solidificabili;
3. La coltura pura e suo isolamento: lo spandimento e lo strisciamento, il re-isolamento; le colture di arricchimento;
4. Coltivazione di microrganismi e misurazione dello sviluppo microbico (conta diretta e conta colturale; peso secco; turbidimetria).

Modalità Esame

La prova in itinere, svolta a circa meta’ del semestre, consiste in un questionario con risposte aperte e chiuse.
Chi ha sostenuto la prova in itinere e ne accetta l’esito positivo svolge la prova orale finale su argomenti diversi da quelli oggetto della prova in itinere. In questo caso, l’ orale consiste in 2-3 domande di cui, in genere, 1-2 sulla parte di Microbiologia Generale e 1-2 sulle parti di Ecologia e Biotecnologie Microbiche.
Nel caso non venga svolta la prova in itinere o non se ne accetti l’esito, l’ orale consiste in 3-5 domande di cui, in genere, 1 sulle esercitazioni di laboratorio, 1-3 sulla parte di Microbiologia Generale e 1-2 sulle parti di Ecologia e Biotecnologie Microbiche. In situazioni particolari o peculiarità di uno o più candidati, l'esame potrà essere svolto in forma scritta con cinque domande a risposta aperta, valutate come per l'orale. Ai candidati sarà concessa un'ora e mezzo di tempo per rispondere.
Nell’attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), delle capacità critiche e di formulare di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione ed uso del linguaggio scientifico-tecnico (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).

Testi adottati

Testi suggeriti tra cui scegliere:
- Brock, Biologia dei microrganismi - Microbiologia generale, ambientale e industriale 16/Ed. -Michael T. Madigan, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley, David A. Stahl, W. Matthew Sattley, Pearson, 2022
- Brock, Biologia dei microrganismi - Microbiologia generale, ambientale e industriale 14/E - di Michael T. Madigan, John M. Martinko, David A. Stahl, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley - Pearson, 2015.
- Biologia dei microrganismi di G. Dehò e E. Galli, Casa Editrice Ambrosiana, nuova edizione (3^ edizione), 2018.
- Microbiologia di D.R. Wessner, D. Dupont e T.C. Charles, Casa Editrice Ambrosiana, 2015.
- Brock, Biologia dei Microrganismi di M.T. Madigan e J.M. Martinko, D.A. Stahl, D.P. Clark, Pearson, 2012. Volumi 1 e 2.
- Brock, Biologia dei Microrganismi di M.T. Madigan e J.M. Martinko, Casa Editrice Ambrosiana. Volumi 1 e 2A.
- Biologia dei microrgaismi di G. Dehò e E. Galli, Casa Editrice Ambrosiana, 2012.

Modalità di frequenza

La frequenza è facoltativa anche se è molto consigliata per discussioni in aula e soprattutto per la partecipazione ad attività pratiche e esercitazioni di laboratorio

Bibliografia

- Brock, Biologia dei microrganismi - Microbiologia generale, ambientale e industriale 16/Ed. -Michael T. Madigan, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley, David A. Stahl, W. Matthew Sattley, Pearson, 2022
- Brock, Biologia dei microrganismi - Microbiologia generale, ambientale e industriale 14/Ed. - di Michael T. Madigan, John M. Martinko, David A. Stahl, Kelly S. Bender, Daniel H. Buckley, Pearson, 2015.
- Biologia dei microrganismi di G. Dehò e E. Galli, Casa Editrice Ambrosiana, nuova edizione (3^ edizione), 2018.
- Microbiologia di D.R. Wessner, D. Dupont e T.C. Charles, Casa Editrice Ambrosiana, 2015.

118978 - GENETICA

SILVIA BONGIORNI

Primo Semestre 9BIO/18ita

Obiettivi formativi

Scopo del corso è fornire agli studenti le informazioni necessarie alla comprensione delle basi teoriche della genetica classica e molecolare e degli approcci sperimentali che ne hanno permesso la definizione. Gli studenti dovranno apprendere la logica dell’analisi genetica formale e le metodologie della dissezione genetica dei fenomeni biologici. Verranno fornite le nozioni per capire il cambiamento paradigmatico avvenuto nell'era post-genomica, e verrà stimolata la comprensione dell’importanza dei sistemi modello sia eucariotici sia procariotici.
Il corso si propone di fornire la base per ulteriori studi di approfondimento in tutti i campi della genetica.


RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI
1) Conoscenza e capacità di comprensione (“knowledge and understanding”): Al termine delle attività formative, gli studenti, attraverso le conoscenze della genetica formale, potranno gestire in modo progettuale le metodiche complementari derivanti dalle conoscenze delle tecniche del DNA ricombinante.
2) Capacità di applicare conoscenza e comprensione (“applying knowledge and understanding”): Gli studenti saranno stimolati a selezionare gli approcci metodologici/sperimentali più appropriati e rilevanti per il raggiungimento di specifici obiettivi (es. produzione biotecnologica di farmaci, proteine ricombinanti ecc.).
3) Autonomia di giudizio (“making judgements”): L’insegnamento fornirà allo studente la capacità di lavorare in autonomia fornendo appropriate tipologie di materiali didattici (lezioni in forma di presentazioni, specifiche monografie, letteratura scientifica rilevante, piattaforme informatiche) e lo svolgimento di congrue attività di laboratorio sincronizzate con la parte teorica del corso.
4) Abilità comunicative (“communication skills”): Gli studenti saranno stimolati ad una attiva partecipazione alle lezioni ed opportunamente stimolati alla progettazione e soluzione di specifici scenari inerenti alle differenti fasi evolutive del corso.
5) Capacità di apprendere (“learning skills”): Le capacità di apprendimento degli studenti saranno valutate in itinere e verificate attraverso la singola capacità di risolvere rilevanti e specifici scenari di interesse, diversi da quelli prospettati durante il corso.

Scheda Docente

Programma del corso

1. La trasmissione dei caratteri
1.1 Le leggi di Mendel: fattori e principi dell’eredità
1.2 Estensioni delle leggi di Mendel: correlazioni complesse fra genotipo e fenotipo
1.3 La teoria cromosomica dell’eredità
1.4 Associazione e mappatura dei geni sui cromosomi

2. Natura e azione dei geni
2.1 DNA: struttura, replicazione e ricombinazione
2.2 L’espressione genica: il flusso dell’informazione dal DNA alle proteine passando per l’RNA

3. Le mutazioni
3.1 Dissezione dell’anatomia e della funzione dei geni attraverso le mutazioni

4. I cromosomi.
4.1 Il cromosoma eucariotico.
4.2 Riarrangiamenti cromosomici.
4.3 Alterazioni della ploidia.
4.4 Eredità non mendeliana degli organelli extranucleari

5. La genetica dei batteri

6. La regolazione della funzione dei geni
6.1 La regolazione genica nei procarioti
6.2 La regolazione genica negli eucarioti
6.3. L’epigenetica

7. Oltre i geni e il genoma del singolo individuo.
7.1 Genetica di popolazione
7.2 Analisi genetica dei caratteri complessi

8. Genetica applicata
8.1 La manipolazione genica
8.2 Le biotecnologie genetiche

Modalità Esame

Durante la settimana di sospensione della didattica del mese di novembre, sarà possibile svolgere una valutazione in itinere su una parte del programma, verosimilmente la seguente:

1. La trasmissione dei caratteri
a. Le leggi di Mendel: fattori e principi dell’eredità
b. Estensioni delle leggi di Mendel: correlazioni complesse fra genotipo e fenotipo
c. La teoria cromosomica dell’eredità
d. Associazione e mappatura dei geni sui cromosomi

La prova in itinere di novembre si intende superata se lo studente abbia raggiunto una valutazione uguale o maggiore di 18/30.

La prova in itinere di novembre ha validità per l’intero anno accademico 2024/2025, cioè fino agli appelli di settembre 2025 (compresi).

Durante gli appelli successivi (sessione gennaio-febbraio, aprile, giugno-luglio, settembre) si svolgerà una prova scritta finale sulla seconda parte del corso, oppure prove scritte su tutto il programma per chi non ha superato o sostenuto l’esonero di novembre.

Tutte prove scritte, compresa la prova in itinere di novembre, consistono principalmente in esercizi ma anche in domande aperte.

Gli esercizi consistono nell'applicazione pratica delle nozioni di Genetica spiegate a lezione e che permettano di capire se lo studente abbia acquisito la capacità di ragionare secondo i paradigmi della trasmissione ereditaria dei caratteri.
Gli esercizi assegnati non si discostano da quelli svolti nelle esercitazioni.

Il voto finale risulta dalla media fra la prova in itinere (se sostenuta) e la prova scritta finale.

Se il voto finale è uguale o superiore a 18/30 lo studente può di norma decidere di confermarlo, senza sostenere la prova orale.

Testi adottati

Genetica. Dall'analisi formale alla genomica
Michael Goldberg, Janice A. Fischer, Leroy Hood
McGraw-Hill Education
III° edizione italiana

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali in aula, presentazioni (ppt) con illustrazioni grafiche, fotografie e video. Esercitazioni volte alla risoluzione di problemi che dimostrano le conoscenze degli aspetti formali della genetica e la capacità di applicarli, sulla fattispecie degli esercizi che costituiranno i compiti di esame.
Le lezioni frontali equivalgono a 9 cfu (72 ore)

Modalità di frequenza

Facoltativa

Bibliografia

Genetica. Dall'analisi formale alla genomica
Michael Goldberg, Janice A. Fischer, Leroy Hood
McGraw-Hill Education
III° edizione italiana

119530 - BIOINFORMATICA PER LA GENOMICA

MARCO MILANESI

Secondo Semestre 6AGR/17ita

Obiettivi formativi

Conoscenza degli strumenti bioinformatici maggiormente utilizzati per lo studio del genoma. Accesso a database biologici, conoscenza delle tecniche di sequenziamento DNA, codici per l'allineamento e l'assemblaggio delle sequenze di DNA, studio dell'espressione genica dall'analisi di dati di RNAseq

Scheda Docente

Programma del corso

La complessità dei genomi. Tecniche di indagine high throughput degli acidi nucleici. Algoritmi e software per l'assembly delle sequenze di DNA. Banche dati di interesse biologico. Metodi bioinformatici per il controllo di qualità delle reads NGS (Next Generation Sequencin). Principi di interrogazione dei database. Analisi RNA-seq. Algoritmi di allineamento. Manipolazione di sequenze di acidi nucleici e query a DEI in Python

Modalità Esame

Nella valutazione delle prova scritta a domande aperte, nell'attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).

Testi adottati

Materiale didattico: slide e video su moodle
Testo opzionale: 'Fondamenti di bioinformatica' di Manuela Helmer Citterich, Fabrizio Ferre, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi.

Modalità di frequenza

La frequenza delle lezioni frontali non è obbligatoria ma vivamente consigliata, in presenza.

Bibliografia

'Fondamenti di bioinformatica' di Manuela Helmer Citterich, Fabrizio Ferre, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi.

119576 - CHIMICA BIOLOGICA

FRANCESCO BUONOCORE

Secondo Semestre 9BIO/10ita

Obiettivi formativi

Coerentemente con gli obiettivi formativi generali enunciati nella corrispondente sezione della
scheda SUA, questo corso d’insegnamento si propone di fornire agli studenti del corso di laurea
triennale in Biotecnologie (classe L-2) i fondamenti della Biochimica, intesa come disciplina che
studia la struttura e la funzione biologica delle biomolecole, oltre che le reazioni metaboliche alle
quali esse partecipano. L’acquisizione dei concetti biochimici di base ha lo scopo di dotare gli
aspiranti biotecnologi di conoscenze teoriche e di strumenti metodologici indispensabili per la loro
futura attività professionale, oltre che per attendere - con profitto - ai contenuti degli altri
insegnamenti del secondo e terzo anno.
Il corso di Chimica Biologica inizia con l’illustrazione delle relazioni struttura-funzione di alcune
biomolecole (amminoacidi, proteine, carboidrati e lipidi) e del loro comportamento in ambiente
acquoso. Il corso prosegue, quindi, affrontando i principi fondamentali della cinetica enzimatica e
della bioenergetica. Nella parte finale, il corso affronterà lo studio delle vie centrali del metabolismo
cellulare.
Nello specifico, gli obiettivi di questo corso d’insegnamento possono così riassumersi:
1. conoscenza e capacità di comprensione di informazioni generali sugli aspetti chimici e biologici
degli aminoacidi proteici, di peptidi e proteine;
2. conoscenza e capacità di comprensione applicate a fenomeni biologici quali la denaturazione
reversibile delle proteine e del processo folding proteico;
3. comprensione dei fenomeni allosterici;
4. acquisizione dei concetti di base della cinetica enzimatica e della bioenergetica;
5. aspetti generali del metabolismo;
6. autonomia di giudizio;
7. abilità comunicative;
8. capacità di apprendere.
Tali conoscenze saranno da applicare in ambito biotecnologico. Saranno valutate le capacità
comunicative e l'attitudine ad imparare.

Scheda Docente

Programma del corso

PARTE GENERALE
I principi generali dell'indagine biochimica. Gli elementi chimici della materia vivente; l'acqua e le sue proprietà chimico-fisiche; il ruolo dell’acqua nei processi biologici; il legame idrogeno e gli altri legami deboli. Interazioni tra molecole e macromolecole di interesse biologico. Soluzioni tampone.
Struttura e proprietà degli aminoacidi proteici. Legame peptidico e geometria del gruppo peptidico. Ionizzazione di aminoacidi. Le proteine e le loro molteplici funzioni. La struttura primaria, secondaria, terziaria e quaternaria delle proteine. Studio della struttura e della funzione di proteine globulari (mioglobina, emoglobina e immunoglobuline) e fibrose (collageno e cheratine). Il folding delle proteine e i meccanismi cellulari che aiutano tale processo.
Carboidrati. Struttura e proprietà dei principali carboidrati. Lipidi. Lipidi semplici e complessi. Struttura e proprietà di acidi grassi, triacilgliceroli e dei principali lipidi di membrana. Natura, ruolo e classificazione degli enzimi. Coenzimi e vitamine.
Cinetica e termodinamica delle reazioni catalizzate. Equazione di Michaelis-Menten. Significato e determinazione di KM, VMAX e Numero di turnover. Inibizione enzimatica. Principi di regolazione dell’attività enzimatica. Enzimi allosterici.
METABOLISMO
Aspetti generali del metabolismo: reazioni endoergoniche ed esoergoniche; composti ad alta energia; reazioni accoppiate; scopi e aspetti distintivi del catabolismo e dell'anabolismo.
La glicolisi e il destino aerobico del piruvato; il complesso enzimatico della Piruvato deidrogenasi. Le vie fermentative del piruvato. Il ciclo dell'acido citrico. La via del fosfogluconato. Il processo di gluconeogenesi. Metabolismo di disaccaridi e polisaccaridi (glicogeno e amido). Regolazione del metabolismo dei carboidrati.
La produzione di energia nel metabolismo centrale; la catena di trasporto degli elettroni e la fosforilazione ossidativa. Il catabolismo delle proteine. Turnover proteico, l'ubiquitina e il complesso del proteasoma. Enzimi proteolitici coinvolti nel processo di digestione delle proteine alimentari e loro specificità. Destino dell'azoto alfa-amminico degli aminoacidi. Considerazioni generali sul destino dello scheletro carbonioso degli aminoacidi.
Cenni sul catabolismo dei triacilgliceroli (lipasi e beta-ossidazione degli acidi grassi) e sul Ciclo dell'urea.

Modalità Esame

Lezioni frontali in aula utilizzando anche presentazioni (ppt) con illustrazioni grafiche, fotografie, oggetti tridimensionali virtuali, video, animazioni.
Lessons in the classroom with power point presentations, videos, animations.
Modalità di valutazione
L’accertamento dell’effettiva acquisizione dei risultati di apprendimento (sopra descritti) avverrà mediante una prova di esame orale.
L’esame si svolgerà rivolgendo allo studente una serie di domande tese a verificare e valutare:
- la conoscenza delle nozioni biochimiche di base;
- l’acquisizione di una capacità (dello studente) di utilizzare queste conoscenze per risolvere specifici quesiti biochimici;
- il grado di capacità comunicativa (uso di un corretto linguaggio scientifico – concisione, chiarezza ed efficacia nella risposta e/o nell’argomentazione).
Allo studente saranno rivolte almeno tre domande su argomenti del corso, quali:
- aspetti della biochimica di base;
- aspetti strutturali delle biomolecole;
- uno specifico metabolismo.
Una prova in itinere potrà essere effettuata.

Testi adottati

Principali testi adottati:
OET, VOET, PRATT: Fondamenti di biochimica (Zanichelli Editore).
NELSON, COX: I Principi di Biochimica di Lehninger (Zanichelli Editore).

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali in aula utilizzando anche presentazioni (ppt) con illustrazioni grafiche, fotografie, oggetti tridimensionali virtuali, video, animazioni.

Modalità di frequenza

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria. Tuttavia la partecipazione alle lezioni in presenza è vivamente consigliata.

Bibliografia

Non è presente una particolare bibliografia di riferimento. Gli argomenti sono tutti presenti sui libri di testo

119577 - BIOLOGIA MOLECOLARE

ANNA GRAZIA FICCA

Secondo Semestre 9BIO/11ita

Obiettivi formativi

Obiettivi formativi (in termini di risultati di apprendimento attesi)
Al termine del corso, lo studente possiede adeguate conoscenze dei principi fondamentali e dei meccanismi di base della biologia molecolare. In particolare, lo studente è in grado di comprendere e discutere la struttura degli acidi nucleici, del genoma e della cromatina; i meccanismi molecolari della replicazione, della trascrizione, della regolazione genica e della sintesi proteica. Conosce infine i principi alla base delle principali tecniche di Biologia Molecolare quali il clonaggio, la PCR e il sequenziamento del DNA per applicazioni pratiche nel campo biomedico, farmaceutico, industriale e vegetale.

Scheda Docente

Programma del corso

Programma.
Aspetti storici: dalla scoperta del DNA al codice genetico

La struttura del DNA
a) struttura chimica degli acidi nucleici – struttura a doppia elica – i parametri strutturali e stabilità della doppia elica - conformazioni delle eliche (A, B, Z) - denaturazione e rinaturazione delle eliche.
b) Organizzazione del DNA: superavvolgimento- impacchettamento del genoma – le proteine (nucleosomi) ed i livelli di organizzazione della cromatina nei sistemi eucariotici. Analisi della cromatina mediante digestione enzimatica con nucleasi.

La struttura dell'RNA
a) chimica del ribosio
b) L'RNA assume strutture secondarie e terziarie.

La Replicazione del DNA: modello del replicone - l'inizio e la terminazione della replicazione nei procarioti e negli eucarioti – le DNA polimerasi, classificazioni e proprietà biochimiche.

La trascrizione nei procarioti: i meccanismi molecolari e la regolazione
• Struttura della RNA polimerasi e i fattori sigma. Struttura dell’ Operone. Siti Operatore e Promotori (promotori forti e deboli). .
• Repressori ed attivatori: l’ operone Lac e l’ operone araBAD
• L’ attenuazione: l’ operone del Trp

La trascrizione negli eucarioti: i meccanismi molecolari e la regolazione
• Le RNA polimerasi I, II, III e fattori generali della trascrizione. Il motivo CTD della subunità maggiore dell’RNA polimerasi II e ruolo funzionale.
• Regolazione della trascrizione negli eucarioti: struttura modulare dei promotori eucariotici – regione enhancer – struttura dell’ enhanceosoma – struttura modulare dei fattori di trascrizione (trans-attivatori) che regolano la trascrizione. Esempi di attivazione della trascrizione ( geni regolati da ormoni tiroidei, attivazione del gene IFNB).

Processamento, maturazione e modificazioni chimiche dei trascitti:
• processamento degli rRNA e tRNA
• capping, poliadenilazione e splicing degli mRNA eucariotici
Editing dell'RNA

La Traduzione dell’ mRNA: apparato di traduzione e suoi componenti
• ribosoma – rRNA – tRNA – aminoacil-tRNA sintetasi – fattori d’inizio, d’allungamento e terminazione della traduzione - antibiotici inibitori della sintesi proteica.
• Il codice genetico: la decifrazione - la degenerazione - le deviazioni.

Manipolazioni genetiche: uso delle endonucleasi per le strategie di clonaggio molecolare – elettroforesi - interpretazione di un profilo di restrizione enzimatica del DNA - tecniche di clonaggio - i vettori di clonaggio - amplificazione genica - metodo Sanger per il sequenziamento del DNA- analisi dei promotori (uso di geni reporter).

Il programma verrà svolto durante le ore di lezione frontale che saranno pari a 64 (32 lezioni) e 4 (2 lezioni) presso il laboratorio di Bioinformatica (previa disponibilità dell'aula)

Saranno organizzate esercitazioni pratiche presso il laboratorio didattico di Biochimica (8 ore, 1 CFU).
La data e l’orario delle esercitazioni saranno comunicati direttamente dal docente in aula.
Il docente determinerà le modalità per la suddivisione nei gruppi di lavoro e comunicherà i turni di laboratorio. Alle esercitazioni saranno ammessi gli studenti che avranno frequentato un numero di lezioni distribuite lungo tutto il periodo del corso. Il numero verrà definito ad inizio corso.

Modalità Esame

Lo studente dovrà dimostrare di aver appreso tutti gli argomenti del programma del corso. A secondo della numerosità degli iscritti ai singoli esami, la verifica potrà essere svolta mediante colloquio orale oppure mediante un esame scritto (test che comprende quiz a domanda singola o a risposta multipla).
Esempio: lo studente descriva il processo di trascrizione del DNA in RNA nei sistemi procariotici

Testi adottati

Si può scegliere il testo da adottare tra questi suggeriti:
Watson,J.D., Baker T.A., Bell S.P. Gann A., Levine M., Losick R. "Biologia molecolare del gene" VIII edizione (2022) Zanichelli

Capranico G., Martegani E., Musci G., Raugei G., Russo T., Zambrano N., Zappavigna V. "Biologia molecolare" II edizione (2022) EdiSES

Amaldi F., Benedetti P. Pesole G., Plevani P., "Biologia molecolare" terza ed. (2018) ed. Casa editrice Ambrosiana
Lizabeth A. Allison "Fondamenti di Biologia molecolare" II ed (2023) Zanichelli

Ulteriore materiale didattico (video, file pdf, quiz per testare il livello di apprendimento) verranno forniti dal docente.

Modalità di svolgimento

La didattica è rappresentata da lezioni frontali.
Per la didattica saranno usate diapositive in formato ppt e video dimostrativi selezionati dal docente.
Il materiale didattico sarà disponibile sul sito Google classroom utilizzando un numero di accesso fornito dal docente.
Tale materiale non è sostitutivo dei testi di riferimento ma integrativo ed esplicativo di questi, e costituisce una guida per la selezione e la comprensione degli argomenti da trattare.

Saranno organizzate esercitazioni pratiche (1 CFU) presso i laboratori didattici. Al termine dell'esercitazione è richiesta la consegna di una relazione.
Le modalità di partecipazione verranno fornite dal docente durante il corso.

Modalità di frequenza

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria. Tuttavia, considerando che la didattica sarà
organizzata per assicurare la centralità del ruolo attivo dello studente, la partecipazione alle lezioni è
vivamente consigliata soprattutto per poter partecipare alle esercitazioni pratiche che si terranno verso la fine del corso..

Bibliografia

Si può scegliere il testo da adottare tra questi suggeriti:
Watson,J.D., Baker T.A., Bell S.P. Gann A., Levine M., Losick R. "Biologia molecolare del gene" VIII edizione (2022) Zanichelli

Capranico G., Martegani E., Musci G., Raugei G., Russo T., Zambrano N., Zappavigna V. "Biologia molecolare" II edizione (2022) EdiSES

Amaldi F., Benedetti P. Pesole G., Plevani P., "Biologia molecolare" terza ed. (2018) ed. Casa editrice Ambrosiana
Lizabeth A. Allison "Fondamenti di Biologia molecolare" II ed (2023) Zanichelli

Ulteriore materiale didattico (video, file pdf, quiz per testare il livello di apprendimento) verranno forniti dal docente.

119529 - FISIOLOGIA UMANA

DAVIDE CERVIA

Secondo Semestre 9BIO/09ita

Obiettivi formativi

a) OBIETTIVI FORMATIVI
Comprendere gli elementi di base delle funzioni dell’organismo ed in particolare saper descrivere: i principi fondamentali di fisiologia cellulare e di elettrofisiologia; le interazioni elementari delle cellule; l’organizzazione e la funzionalità generale del sistema nervoso; i meccanismi della trasduzione sensoriale, della contrattilità muscolare, e dei principali sistemi vegetativi responsabili dell’omeostasi corporea.

b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI (Descrittori di Dublino)
CONOSCENZA E CAPACITA' DI COMPRENSIONE: Per il superamento dell’esame lo studente dovrà dimostrare di aver raggiunto una conoscenza e una capacità di comprensione delle tematiche inerenti il funzionamento dell’organismo e delle sue componenti nervose e non eccitabili che gli permetta di impostare la discussione di problematiche teoriche in modo logico e completo.
CAPACITA' DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: Lo studente dovrà dimostrare di saper impostare la trattazione di problemi applicativi nell'ambito della Fisiologia generale e dei sistemi integrati.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Lo studente dovrà avere acquisito conoscenze tali da permettergli di descrivere i meccanismi alla base delle funzioni trattate e saper valutare in modo autonomo e motivato eventuali opinioni diverse su eventuali aspetti problematici.
ABILITA' COMUNICATIVE: Al termine del corso, lo studente dovrà aver raggiunto un'appropriata organizzazione di un proprio pensiero, intorno alle diverse tematiche del corso, da permettergli di esporre gli argomenti in forma organica e con linguaggio scientifico appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO: Lo studente dovrà essere capace di esaminare e comprendere testi e materiale scientifico, in modo tale da impiegarli in contesti quotidiani per la professione e per la ricerca.

Scheda Docente

Programma del corso

Fisiologia della cellula: membrana cellulare e trasporti, comunicazione tra cellule, proprietà elettriche attive e passive, trasmissione sinaptica e conduzione del segnale nervoso.
Organizzazione generale del sistema nervoso, tipi cellulari.
Funzione sensoriale: sistema somatosensoriale, visivo, uditivo, vestibolare, gustativo, olfattivo.
Fisiologia del muscolo scheletrico.
Funzione cardiaca e circolatoria.
Funzione respiratoria.
Funzione renale.
Funzione endocrina.

Modalità Esame

Lo studente deve dimostrare di aver acquisito i principi di base che regolano le funzioni e la comunicazione delle cellule, con particolare riferimento alle cellule eccitabili. Lo studente dovrà conoscere i processi fisiologici ed i meccanismi di funzionamento del sistema nervoso, muscolare, delle strutture sensoriali e dei principali sistemi vegetativi.
A seconda dell'appello, la modalità di valutazione potrà essere solo orale, solo scritta o entrambe (a scelta).
Nella prova orale la conoscenza e la padronanza degli argomenti, la chiarezza espositiva, la visione della disciplina e l'uso corretto della terminologia tecnica saranno considerati come elementi di valutazione (espresso in 30esimi; sufficiente 18).
Nella prova scritta sarà somministrato un test con 30 domande a risposta multipla di cui una sola corretta (espresso in 30esimi; sufficiente con 15 risposte giuste).

Testi adottati

-“Fisiologia, dalle molecole ai sistemi integrati”, Carbone, Cicirata, Aicardi (EdiSES)
-“Fisiologia Umana, Fondamenti”, Autori vari (Edi-Ermes)
-"Fisiologia", Berne & Levy (CEA)
-"Fisiologia medica", Guyton & Hall (Edra)
- possono comunque andare bene anche altri testi di Fisiologia generale, purché aggiornati
- “slides” delle lezioni messe a disposizione dal docente a fine corso sulla piattaforma istituzionale (importanti come integrazione dettagliata del programma svolto)

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali

Modalità di frequenza

La partecipazione alle lezioni non è obbligatoria

Bibliografia

-“Fisiologia, dalle molecole ai sistemi integrati”, Carbone, Cicirata, Aicardi (EdiSES)
-“Fisiologia Umana, Fondamenti”, Autori vari (Edi-Ermes)
-"Fisiologia", Berne & Levy (CEA)
-"Fisiologia medica", Guyton & Hall (Edra)

INSEGNAMENTOSEMESTRECFUSSDLINGUA
16177 - CHIMICA FISICA BIOLOGICA

FERNANDO PORCELLI

Primo Semestre 7CHIM/02ITA

Obiettivi formativi

Il corso introdurrà gli studenti ai principi e agli approcci sperimentali propri della chimica fisica applicati alle scienze biologiche. Scopo del corso è fornire agli studenti le informazioni necessarie per una conoscenza critica dei principi e delle applicazioni della chimica fisica che vanno dalla termodinamica classica, alla cinetica, all'elettrochimica ed alle teorie quantomeccaniche necessarie per la comprensione della spettroscopia. Tali argomenti verranno trattati prestando particolare attenzione alle loro applicazioni in campo biotecnologico,
Risultati apprendimento
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE : conoscere i principi che stanno alla base della chimica fisica con particolare riguardo al trattamento termodinamico, cinetico e quantomeccanico, ed essere in grado di comprenderne le potenzialità ed il loro utilizzo per lo studio di sistemi biologici. CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: partendo dagli esempi discussi durante il corso avere una comprensione dei differenti approcci teorico-sperimentali per la risoluzione di problemi in campo biotecnologico.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO: essere in grado di interpretare i risultati sperimentali e di calcolo ottenuti e discuterli in maniera logica.
CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: essere in grado di descrivere temi scientifici inerenti i sistemi biomolecolari utilizzando in maniera critica le metodologie e le tecniche trattate nel corso.
ABILITA' COMUNICATIVE: Essere in grado di discutere temi scientifici inerenti la chimica fisica ed applicarli a processi biologici e biotecnologici.

Scheda Docente

Programma del corso

Proprieta’ dei gas. Il gas perfetto. Le leggi dei gas. I gas reali.

Il primo principio. Lavoro, Calore ed Energia. Il primo principio della termodinamica: energia interna, Entalpia e Capacità termica. Termochimica. Alimenti e scorte di energia Le entalpie di formazione standard. La dipendenza dell’entalpia di reazione dalla temperatura ITC e “ligand binding” . DSC: Differential Scanning Calorimetry Energetica delle interazioni molecolari.

Il secondo principio. Trasformazioni spontanee e dispersione dell’energia. L’Entropia. Variazioni di entropia. Entropia ed interpretazione statistica. Energia libera di Gibbs. Potenziale chimico ed equilibrio. Le soluzioni: soluzioni ideali (legge di Raoult e legge di Henry). Soluzioni ideali diluite: attività Miscele semplici. Grandezze parziali molari. Processi di mescolamento. Definizione del potenziale chimico per i liquidi. Proprietà colligative: Pressione osmotica
Elettrochimica. Celle elettrochimiche: Potenziali di riduzione ed energia libera. Potenziali di riposo e di azione nei sistemi cellulari.

Cinetica chimica. Velocità di reazione ed ordine di reazione. Equazioni cinetiche integrate. Effetto della temperatura sulla velocità di reazione. Cenni di dinamica di reazione molecolare.

Teoria Quantistica. Insuccessi della Fisica Classica. Dualismo Onda-Corpuscolo. Equazione di Schroedinger. Moto Traslazionale: particella nella scatola. Moto Rotazionale. Moto Vibrazionale.
Cenni di spettroscopia.
Aspetti generali e tecniche sperimentali. Regole di selezione. Spettri rotazionali puri. Spettri vibrazionali. Spettri elettronici di biomolecole. Legge di Lambert-Beer. Cenni di spettroscopia di fluorescenza.

Modalità Esame

L'esame si svolge nelle forme stabilite dall'art. 23 del Regolamento Didattico di Ateneo. Del suo svolgimento viene redatto apposito verbale, sottoscritto dal Presidente e dai membri della commissione e dallo studente esaminato. Il voto è espresso in trentesimi, con eventuale lode. Il superamento dell'esame presuppone il conferimento di un voto non inferiore ai diciotto/trentesimi e comporta l'attribuzione dei corrispondenti crediti formativi universitari. Nella valutazione delle prova e nell’attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (errori nell’applicare i concetti, discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).
L'esame consta di una prova orale sugli argomenti trattati che mira a valutare
a) il grado di preparazione raggiunto,
b) la chiarezza espositiva,
c) la capacità di collegare osservazioni e concetti.
Nel corso della prova potranno essere trattati anche esempi numerici.

Testi adottati

Atkins De Paula - Elementi di Chimica Fisica, Zanichelli

Atkins- De Paula: Chimica Fisica Biologica, Zanichelli.
Klostermeier D. - Rudolph MG: Biophysical Chemistry, CRC Press
R. Chang : Chimica Fisica 1, 2 vol., Zanichelli
Donald A. McQuarrie, John D. Simon: Chimica Fisica Un approccio molecolare, Zanichelli
Kuriyan-Konforti-Wemmer: The Molecules of Life. Garland Sciences

Modalità di svolgimento

Le lezioni frontali verranno svolte in aula con l'ausilio di presentazioni power point con illustrazioni grafiche. Derivazioni di relazioni verranno esplicitate alla lavagna per analizzarne i vari passaggi e renderle chiare a tutti. Nel corso verranno anche effettuate esercitazioni numeriche. Durante il semestre verranno effettuate delle prove in itinere (3).


Modalità di frequenza

La frequenza non e' obbligatoria

Bibliografia

Appunti del corso
Atkins De Paula - Elementi di CHimica Fisica, Zanichelli
Atkins- De Paula: Chimica Fisica Biologica, Zanichelli.
Klostermeier D. - Rudolph MG: Biophysical Chemistry, CRC Press
R. Chang : Chimica Fisica 1, 2 vol., Zanichelli
Donald A. McQuarrie, John D. Simon: Chimica Fisica Un approccio molecolare, Zanichelli
Kuriyan-Konforti-Wemmer: The Molecules of Life. Garland Sciences

GRUPPO OPZIONALE A11 PROFILO BIOLOGICO-INDUSTRIALE - -- -
PRINCIPI DI SCIENZE OMICHE

ANNA MARIA TIMPERIO

6BIO/11ita

Obiettivi formativi

OBIETTIVI FORMATIVI:

il corso di scienze 'OMICHE' si propone di guidare lo studente in un percorso che parte dalle nozioni base della chimica delle proteine per arrivare alle loro più ampie e recenti applicazioni nello studio globale delle proteine espresse in specifiche condizioni o delle interazioni proteina-proteina al fine di definire il ruolo funzionale di una proteina nel contesto biologico di appartenenza. Durante il corso gli studenti acquisiranno nozioni sulle principali tecniche analitiche e preparative impiegate in studi di proteomica e competenze teorico-pratiche nell’identificazione di proteine e nell’interpretazione di spettri di massa MALDI ed ESI in applicazioni biomolecolari.

b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI:
1) Conoscenza e capacità di comprensione:
Aver acquisito una buona capacità di comprensione delle scienze omiche in ambito biotecnologico

2) Conoscenza e capacità di comprensione applicata:
Saper integrare le conoscenze acquisite nelle singole discipline in un sapere interdisciplinare necessario per affrontare qualsiasi problema complesso nel settore delle biotecnologie in particolare saper applicare le conoscenze di spettrometria di massa alle diverse applicazioni relative alle biotecnologie.

3 ) Autonomia di giudizio
Gli studentid dovranno sviluppare la capacità di elaborare informazioni complesse e/o frammentarie e di pervenire a idee e giudizi originali e autonomii capace di reperire e selezionare criticamente le sorgenti di dati bibliografici , banche dati, e la
letteratura in campo scientifico. L'autonomia di giudizio viene sviluppata tramite lo studio critico di articoli scientifici.

4) Abilità comunicative:
Lo studente sarà in grado di sostenere una discussione critica pubblica sugli argomenti trattati in particolare sarà capace di applicare le tecniche di proteomica per qualsiasi argomento scientifico di interesse.. Sarà capace di lavorare in gruppo nell'ambito della progettazione ed esecuzione di protocolli sperimentali perchè sono previsti crediti di laboratorio.

5) Capacità di apprendere:
Lo studente avrà la capacità di individuare, applicare e sviluppare tecniche innovative nel campo di pertinenza, di
lavorare in modo autonomo.

Scheda Docente

Programma del corso

PRINCIPI DI SCIENZE “OMICHE”
Introduzione:
• Scienze “omiche” e biologia dei sistemi complessi.
• La rivoluzione dell'ipotesi a posteriori e la ricerca di nuove ipotesi.
• Cosa sono le scienze “omiche”?.
• Dalle proteine alla proteomica, dai metaboliti alla metabolomica e dai lipidi alla lipidomica.
• Relazione tra la proteomica e le altre scienze post-genomiche.
Piattaforme tecnologiche:
• Preparazione del campione (piante, batteri, animali): preparazione dell’estratto proteico per analisi DIGE, linee generali di preparazione dei campioni per analisi LC-MS.
• Analisi dell’espressione proteica, di metaboliti e di lipidi mediante tecniche elettroforetiche
o Applicazioni dell’ SDS-PAGE e dell’IEF alla proteomica, metabolomica e lipidomica.
o DIfferential Gel Electrophoresis (DIGE), 2D-DIGE a saturazione
o Elettroforesi capillare (CE), elettroforesi bidimensionale (2DE).
o Applicazioni della 2-DE in proteomica: limiti e prospettive.
o Elettroforesi Blu Nativa su gel di poliacrilammide (Blue Native PAGE).
o Clear Native PAGE (CN-PAGE).
o Elettroforesi ‘gel free’
o Elettroforesi su acetato di cellulosa
• Metodi di rivelazione post analisi: Colorazione inversa, Coloranti fluorescenti, Analisi d’immagine per tecnologie multiplexing
• Metodi di rivelazione di modifiche post-traduzionali in spettrometria di massa:
o Glicosilazione, Fosforilazione, Nitrazione, Carbonilazione
• Analisi dell’espressione proteica mediante tecniche cromatografiche:
o Approccio proteomico Bottom-up
o Approccio proteomico Middle-down
o Approccio proteomico top-down
o Separazioni multidimensionali
• Spettrometria di massa: introduzione e concetti di risoluzione ed accuratezza
o Le sorgenti più impiegate in ambito proteomico: MALDI, ESI
o Le sorgenti più impiegate in campo metabolomico: EI
o Le sorgenti più impiegate in campo lipidomico: ESI, MALDI
o Gli analizzatori: quadrupolari, TOF, e trappole ionica, ORBITRAP, ibridi
• La spettrometria di massa tandem (MS\MS)
Metodi quantitativi: sistemi di cromatografia liquida (LC) a fase inversa (RP) accoppiata ad analisi di spettrometria di massa.
o Strategie di quantificazione relativa basate sulla marcatura con isotopi stabili (iTRAQ, SILAC spike-in, Super-SILAC e organismi SILAC, ICAT, O18)
o Strategie di quantificazione relativa senza marcatura (metodiche “label-free”: intensity-based e spectral-counting, calcolo del PAI e dell’emPAI).
o Proteomica , metabolomica e lipidomica quantitativa mirata: SRM
Tecniche accoppiate: GC-MS, EC-MS, LC-MS\MS, MudPIT

Anna Maria Timperio

Modalità Esame

L'esame si svolge nelle forme stabilite dall'art. 23 del Regolamento Didattico di Ateneo. Del suo svolgimento viene redatto apposito verbale, sottoscritto dal Presidente e dai membri della commissione e dallo studente esaminato. Il voto è espresso in trentesimi, con eventuale lode. Il superamento dell'esame presuppone il conferimento di un voto non inferiore ai diciotto/trentesimi e comporta l'attribuzione dei corrispondenti crediti formativi universitari. Nella valutazione delle prova e nell’ attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (errori nell’applicare i concetti, discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).

Testi adottati

T. Alberio, M. Fasano, P. Roncada "PROTEOMICA" EdiSES; I. Lavagnini, F. Magno, R. Seraglia e P. Traldi "Quantitative Applications of Mass Spectrometry (English Edition)" WILEY.

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali in aula supportate da presentazioni in PowerPoint con figure, schemi di processo e video. Per tale attività sono previste 40 ore. Sono previste anche esercitazioni in laboratorio didattico che metteranno gli studenti in condizione di prendere confidenza con la preparazione dei tamponi e estrazioni di materiale biologico, determinazione di proteine e loro analisi in spettrometria di massa. Per questa attività sono previste 8 ore.

Modalità di frequenza

Lezioni frontali in aula supportate da presentazioni in PowerPoint con figure, schemi di processo e video. Per tale attività sono previste 40 ore. Sono previste anche esercitazioni in laboratorio didattico che metteranno gli studenti in condizione di prendere confidenza con la preparazione dei tamponi e estrazioni di materiale biologico, determinazione di proteine e loro analisi in spettrometria di massa. Per questa attività sono previste 8 ore.

Bibliografia

Liebler DC. Introduction to proteomics: tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press
2002.
Rivista Società Italiana di Medicina Generale N.5 VOL.25 2018

NEUROSCIENZE E NEUROTECNOLOGIE FONDAMENTALI

ELISABETTA CATALANI

6BIO/09ita

Obiettivi formativi

a) OBIETTIVI FORMATIVI
Comprendere gli elementi di base della fisiologia e neurofisiologia del sistema nervoso centrale, ed in particolare saper descrivere: gli eventi generali che portano alla formazione delle principali aree del cervello e delle sinapsi, i meccanismi generali di riparazione e rigenerazione, le basi del controllo del movimento, le funzioni cerebrali complesse, le caratteristiche generali di malattie neurodegenerative, i metodi che si possono applicare nell’ambito delle neuroscienze

b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI (Descrittori di Dublino)
CONOSCENZA E CAPACITA' DI COMPRENSIONE: Per il superamento dell’esame lo studente dovrà dimostrare di aver raggiunto una conoscenza e una capacità di comprensione delle tematiche inerenti al funzionamento del sistema nervoso centrale, alla neurodegenerazione e alle neurotecnologie che gli permetta di impostare la discussione di problematiche teoriche in modo logico e completo.
CAPACITA' DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: Lo studente dovrà dimostrare di saper impostare la trattazione di problemi applicativi nell'ambito delle neuroscienze e neurotecnologie.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Lo studente dovrà avere acquisito conoscenze tali da permettergli di descrivere i meccanismi alla base delle funzioni trattate e saper valutare in modo autonomo e motivato eventuali opinioni diverse su eventuali aspetti problematici.
ABILITA' COMUNICATIVE: Al termine del corso, lo studente dovrà aver raggiunto un'appropriata organizzazione di un proprio pensiero, intorno alle diverse tematiche del corso, da permettergli di esporre gli argomenti in forma organica e con linguaggio scientifico appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO: Lo studente dovrà essere capace di esaminare e comprendere testi e materiale scientifico, in modo tale da impiegarli in contesti quotidiani per la professione e per la ricerca.

Scheda Docente

Programma del corso

Sviluppo del sistema nervoso, formazione delle principali aree e delle sinapsi, identità e circuiteria neuronale, riparazione e rigenerazione
Sistema nervoso centrale e neurotrasmissione
Controllo centrale del movimento
Funzioni cerebrali complesse: apprendimento e memoria, ritmo sonno-veglia, rappresentazioni neurali delle emozioni e della coscienza, linguaggio
Malattie neurodegenerative e disturbi del sistema nervoso centrale, cenni
Metodi nelle neuroscienze: elettrofisiologia, elettroencefalografia, flusso sanguigno del cervello, neuroimaging, stimolazione e misurazione dell’attività neurale, modelli in vitro/ex vivo/in vivo di cellule/tessuti del SNC, modelli di barriera ematoencefalica, colture organotipiche

Modalità Esame

Lo studente deve dimostrare di aver acquisito i principi di base che regolano il sistema nervoso centrale e le metodologie che si possono applicare nel campo delle neuroscienze. La conoscenza e la padronanza degli argomenti, la chiarezza espositiva, la visione della disciplina e l'uso corretto della terminologia tecnica saranno considerati come elementi di valutazione (espresso in 30esimi; sufficiente 18).

Testi adottati

- Neuroscienze, autori Purves, Augustine, Fitzpatrick, Hall, Lamantia, Mooney, casa editrice Zanichelli
- Neuroscienze cognitive, autori Gazzaniga, Ivry, Mangun, casa editrice Zanichelli
- Principi di neuroscienze, autori Kandel, Schwartz, Jessel, Siegelbaum, Hudspeth, casa editrice Ambrosiana
- Neuroscienze Esplorando il cervello, autori Bear, Connors, Paradiso, casa editrice Edra
- possono comunque andare bene anche altri testi di Fisiologia umana, purché aggiornati
- articoli scientifici selezionati dal docente
-“slides” delle lezioni messe a disposizione dal docente a fine corso sulla piattaforma istituzionale (importanti come integrazione dettagliata del programma svolto)

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali

Modalità di frequenza

La partecipazione alle lezioni non è obbligatoria

Bibliografia

vedere i libri di testo consigliati

118979 - CHIMICA E BIOTECNOLOGIE DELLE FERMENTAZIONI - 12- -

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

MICROBIOLOGIA DEI PROCESSI FERMENTATIVI

SILVIA CROGNALE

6BIO/19ita

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

MODULO II
Fasi per la messa a punto di un processo fermentativo
Screening e scelta del microrganismo, caratteristiche di un microrganismo di interesse industriale. Conservazione e mantenimento di ceppi di interesse industriale
Miglioramento genetico dei microrganismi.
Fermentazione in sommersa e in stato solido
Tipologie reattoristiche: agitazione meccanica e pneumatica
Modalità di fermentazione: Batch Fed-batch, continuo
Le fermentazione aerobiche, Trasferimento di ossigeno
Casi studio: produzione di polisaccaridi, produzione di penicilline, di proteine ricombinanti produzioni da sciroppi zuccherini

Modalità Esame



Modulo II Tre domande riguardanti un argomento teorico, un argomento pratico e un caso studio fermentativo

Testi adottati

Materiale fornito dal docente

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali
Esercitazioni

Bibliografia

Materiale fornito dal docente

18452 - BIOETICA

ANTOINE HARFOUCHE

Secondo Semestre 7AGR/05ITA

Obiettivi formativi

Obiettivi formativi
Il corso conferisce agli studenti le conoscenze di base sul tema della bioetica. Gli studenti del corso avranno la possibilità di apprendere la realtà più significativa riguardante: le biotecnologie agro-forestali, agro-ambientali, agro-alimentari, le biotecnologie mediche, la proprietà intelletuale e gli aspetti socio-scientifici. Il corso si propone, inoltre, l'obiettivo di collegare gli studenti a riflessioni e dibattiti sulle biotecnologie e di aiutare loro a sviluppare un modello decisionale di bioetica dopo un ragionamento critico etico. I risultati di apprendimento attesi a conclusione dell’insegnamento sono i seguenti:
(i) lo studente sarà in grado di acquisire conoscenze, abilità, e competenze di comprendere, analizzare, e descrivere le implicazioni pratiche e conseguenti questioni etiche delle biotecnologie. Si mira, inoltre, a far acquisire conoscenze teorico-sperimentali dell’etica applicata. Tutte queste conoscenze, abilità, e competenze consentiranno allo studente di comprendere e analizzare sia gli elementi fondamentali della bioetica sia quelli interdisciplinari.
(ii) Lo studente sarà in grado di tradurre sul piano pratico le conoscenze teoriche e di argomentare problematiche nell’ambito della bioetica nelle biotechnologie. Attraverso casi di studio, gli studenti acquisiranno la capacità di applicare sul piano pratico le conoscenze teoriche attuando ragionamento critico e sviluppando modelli decisionali di bioetica.
(iii) Lo studente avrà, inoltre, la capacità di interpretare in modo autonomo sia le conoscenze di base che applicate della bioetica. Questa capacità verrà acquisita, in particolar modo, grazie alla frequenza di attività pratiche e esercizi interattivi in aula.
(iv) Lo studente che frequenta l’insegnamento sarà in grado di comunicare in modo critico, scientifico, e con linguaggio appropriato, le conoscenze connesse con l’etica e bioetica. Tale abilità saranno conseguite anche grazie all’ampio uso che viene fatto delle presentazioni powerpoint in aula e all’interazione, dialogo e scambio di opinioni tra gli studenti e tra studenti ed il docente sia in occasione delle lezioni frontali che durante i casi di studio.
(v) Gli studenti comprenderanno e acquisiranno i metodi di indagine e di pensiero critico in ambito etico e bioetico. Saranno, quindi, in grado di approfondire autonomamente le conoscenze e competenze acquisite. Tale abilità verrà sviluppata mediante il coinvolgimento attivo degli studenti attraverso discussioni orali in aula su temi specifici dell’insegnamento e nei casi di studio.

Scheda Docente

Programma del corso

Descrizione del corso:
Lo sviluppo sostenibile e eticamente responsabile è quello in cui le innovazioni scientifiche siano inglobate e incorporate nei sistemi produttivi, sociali e culturali. Questioni relative alle implicazioni etiche, legali e sociali dei progressi della biotecnologia e della scienza sono sempre in crescita sia in Italia che all'estero.
La bioetica rappresenta un forte appello della coscienza a chiedersi in quale direzione l'umanità stia dirigendo il progresso scientifico e quali siano i criteri per giudicarlo bene o male.
Il ruolo strategico assunto dalla scienza in ambito biotecnologico e socio-economico spinse allora gli scienziati e i ricercatori a cercare il consenso sociale intorno alle loro attività, facendo della comunicazione pubblica “public outreach” della scienza un'assoluta necessità.
Questo corso presenta le principali questioni con cui la bioetica è chiamata oggi a confrontarsi nell'ambito delle biotecnologie. Inoltre, affronta le seguenti domande: come giudicare le applicazioni biotecnologiche avanzate nei settori agro-forestale, agro-ambientale, agro-alimentare, e biomedico sotto il profilo etico? Le biotecnologie sono sicuri, accettabili, e eticamente responsabili? Quali interrogativi etici pongono? Quali sono gli eventuali vantaggi, rischi, benefici, e/o i costi di un loro eventuale utilizzo?
Obiettivi del corso:
Il corso conferisce agli studenti le conoscenze di base sul tema della bioetica. Gli studenti del corso avranno la possibilità di apprendere la realtà più significativa riguardante: le biotecnologie agro-forestali, agro-ambientali, agro-alimentari, le biotecnologie mediche, la proprietà intelletuale e gli aspetti socio-scientifici. Il corso si propone, inoltre, l'obiettivo di collegare gli studenti a riflessioni e dibattiti sulle biotecnologie e di aiutare loro a sviluppare un modello decisionale di bioetica dopo un ragionamento critico etico. I risultati di apprendimento attesi a conclusione dell’insegnamento sono i seguenti:
(i) lo studente sarà in grado di acquisire conoscenze, abilità, e competenze di comprendere, analizzare, e descrivere le implicazioni pratiche e conseguenti questioni etiche delle biotecnologie. Si mira, inoltre, a far acquisire conoscenze teorico-sperimentali dell’etica applicata. Tutte queste conoscenze, abilità, e competenze consentiranno allo studente di comprendere e analizzare sia gli elementi fondamentali della bioetica sia quelli interdisciplinari.
(ii) Lo studente sarà in grado di tradurre sul piano pratico le conoscenze teoriche e di argomentare problematiche nell’ambito della bioetica nelle biotechnologie. Attraverso casi di studio, gli studenti acquisiranno la capacità di applicare sul piano pratico le conoscenze teoriche attuando ragionamento critico e sviluppando modelli decisionali di bioetica.
(iii) Lo studente avrà, inoltre, la capacità di interpretare in modo autonomo sia le conoscenze di base che applicate della bioetica. Questa capacità verrà acquisita, in particolar modo, grazie alla frequenza di attività pratiche e esercizi interattivi in aula.
(iv) Lo studente che frequenta l’insegnamento sarà in grado di comunicare in modo critico, scientifico, e con linguaggio appropriato, le conoscenze connesse con l’etica e bioetica. Tale abilità saranno conseguite anche grazie all’ampio uso che viene fatto delle presentazioni powerpoint in aula e all’interazione, dialogo e scambio di opinioni tra gli studenti e tra studenti ed il docente sia in occasione delle lezioni frontali che durante i casi di studio.
(v) Gli studenti comprenderanno e acquisiranno i metodi di indagine e di pensiero critico in ambito etico e bioetico. Saranno, quindi, in grado di approfondire autonomamente le conoscenze e competenze acquisite. Tale abilità verrà sviluppata mediante il coinvolgimento attivo degli studenti attraverso discussioni orali in aula su temi specifici dell’insegnamento e nei casi di studio.
Scienza ed etica (8 ore)
• Introduzione alla bioetica
• Bioetica e scienze biotecnologiche
• Glossario dei termini e upskilling del pensiero critico etico e del ragionamento etico e dello sviluppo di modelli decisionali di bioetica.

Bioetica in campo delle biotecnologie mediche (8 ore)
• Terapia genica e considerazioni etiche
• Rinunciare alla terapia genica? (Caso di Studio di Bioetica)
• Cellule staminali e bioetica

Bioetica e biotecnologia (8 ore)
• Etica e ingegneria genetica/editing genomico nel settore agricolo e forestale
• Opinione pubblica e accettazione delle biotecnologie agro-forestali
• Impatto ambientale degli organismi geneticamente modificati (OGM)
• Affamati di scienza: come la biotecnologia viene tenuta fuori dall'Africa? (Caso di Studio di Bioetica)

Bioetica, biotecnologia e proprietà intellettuale (8 ore)
• Tutela brevettuale delle biotecnologie
• Obiezioni etiche alla brevettabilità delle biotecnologie
• Brevetto biotecnologico – insulina ed altri (Caso di Studio di Bioetica)
• The Harvard oncomouse vs. the Upjohn mouse (Caso di Studio di Bioetica)

Modello decisionale di bioetica e ragionamento critico etico (16 ore)
• Questioni etiche nella terapia genica umana (3 casi di Studio di Bioetica)
• The Boy in the Plastic Bubble (Caso di Studio di Bioetica)
• Il progetto riso dorato (caso di studio)
• La biotecnologia può essere open-source?
• BiOS, Un'iniziativa scientifica open source
• PIPRA, consentire l'accesso all'innovazione pubblica

Come comunicare in modo efficace i progressi delle bioscienze (8 ore)
• Storeytelling
• Narrazioni
• Bioethics retreat

Modalità Esame

La verifica dell'apprendimento avverrà attraverso le seguenti modalità:
- Prove pratiche: lo studente in un gruppo di altri studenti dovrà partecipare alle attività previsti nel corso.
Esercitazioni: lo studente dovrà predisporre un caso di studio secondo strumenti e materiale fornito durante il corso. Il caso di studio dovrà far riferimento ai temi di biotecnologie, bioetica, e proprietà intelletuale (e.g., bioethics decision-making model). L’esercitazione verterà su una presentazione di un caso di studio di Bioetica approfondendone gli aspetti etici e bioetici.
- Prova orale: è finalizzata a valutare il raggiungimento degli obiettivi del corso ed il grado di preparazione individuale dello studente.

Testi adottati

Il materiale didattico sarà fornito dal docente durante lo svolgimento del corso e reso accessibile a tutti gli studenti sulla piattaforma Moodle e Google Drive.

Modalità di svolgimento

Prova orale, prova pratica, esercitazioni

Modalità di frequenza

La frequenza non è obbligatoria ma fortemente consigliata

Bibliografia

Il materiale didattico sarà fornito dal docente durante lo svolgimento del corso e reso accessibile a tutti gli studenti sulla piattaforma Moodle e Google Drive.

15142 - ESAMI A SCELTA

Secondo Semestre 12ita
18453 - PROVA FINALE

Secondo Semestre 8ita

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

119531 - BIOLOGIA CELLULARE E IMMUNOLOGIA COMPARATA

GIUSEPPE SCAPIGLIATI

Secondo Semestre 6BIO/05ita

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

La cellula animale. La struttura delle membrane cellulari. La membrana plasmatica. Compartimenti intracellulari e vescicole di membrana. Il citoplasma e gli organuli. Citoscheletro e proteine associate. Traffico intracellulare di vescicole e vescicole. Matrice extracellulare, membrana basale, giunzioni intercellulari. Comunicazione e segnalazione cellulare. Recettori accoppiati a proteine di trasduzione e recettori accoppiati a enzimi. Meccanismi di trasduzione del segnale. Calcolo del numero dei recettori. Ciclo cellulare e sua regolazione. Apoptosi. NET-osi. Micro RNA e proteine leganti RNA. CRISPR/CAS, Caratteristiche di cellule in coltura: tecniche e nozioni di colture cellulari. Cellule staminali e applicazioni terapeutiche. Cell Factories. Cellule sintetiche. Colture tridimensionali. Le difese immunitarie animali, Immunità innata e immunità acquisita. Immunologia Comparata e evoluzione delle risposte immunitarie. Cellule e molecole coinvolte nelle reazioni immunitarie. Tecniche immunologiche e immunodiagnostiche. Anticorpi monoclonali e loro impiego.Terapie cellulari.

Modalità Esame

Prova orale con esposizione di argomenti del corso, eventuale prova in itinere

Testi adottati

Gerald Karp, BIOLOGIA CELLULARE E MOLECOLARE, Ed. EDISES
Ginelli, M. Malcovati, MOLECOLE, CELLULE E ORGANISMI, Ed. EDISES
A. Abbas, AH. Lichtman, S Pillai,LE BASI DELL'IMMUNOLOGIA. FISIOPATOLOGIA DEL SISTEMA IMMUNITARIO, Ed. EDRA

Modalità di svolgimento

Modalita' tradizionale in presenza, oppure in remoto quando indispensabile.

Bibliografia

Materiale didattico e bibliografia di riferimento (slides, articoli scientifici, e link a siti di interesse zoologico) verrà messo a disposizione degli studenti e aggiornato periodicamente durante lo svolgimento del Corso.

GRUPPO OPZIONALE A11 PROFILO BIOLOGICO-INDUSTRIALE - -- -
METODOLOGIE BIOCHIMICHE

ESTHER IMPERLINI

6BIO/10ita

Obiettivi formativi

OBIETTIVI FORMATIVI
L’insegnamento di Metodologie Biochimiche intende fornire agli studenti un quadro teorico e pratico di alcune delle principali metodiche preparative e analitiche che trovano impiego non solo nel campo della ricerca biochimica, ma anche in altri campi tra cui quello biomedico e ambientale.
In particolare, le conoscenze impartite riguardano metodologie per l’identificazione, l’isolamento e lo studio strutturale e funzionale delle macromolecole biologiche, nonché strumenti di bioinformatica per l'analisi dei risultati sperimentali e per la loro descrizione. Verranno, inoltre, trattate tecniche per l’analisi sia delle singole proteine che di interi proteomi.

RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI
1. Conoscenza e capacità di comprensione
Al termine del corso gli studenti
- conosceranno i principi alla base delle tecniche impiegate nelle indagini biochimiche (centrifugazione, spettroscopia, elettroforesi, cromatografia, spettrometria) ed i parametri su cui poter agire per mettere a punto una particolare indagine biochimica;
- saranno in grado di descrivere gli elementi strutturali dei principali strumenti di un laboratorio biochimico (centrifuga, spettrofotometro, spettrometro);
- conosceranno correttamente la terminologia appropriata impiegata nelle metodologie biochimiche.

2. Conoscenza e capacità di comprensione applicate
Al termine del corso gli studenti
- saranno in grado di orientarsi correttamente sulla scelta delle più opportune procedure biochimiche per il raggiungimento degli obiettivi sperimentali definiti in fase di progettazione della ricerca;
- sapranno valutare il possibile impatto delle variazioni dei parametri in gioco in un esperimento biochimico e nelle principali indagini strumentali cliniche;
- sapranno svolgere praticamente gli esperimenti affrontati nella parte di laboratorio.

3. Autonomia di giudizio
Gli studenti dovranno essere in grado di comprendere e discutere criticamente i risultati sperimentali ottenuti in laboratorio ed utilizzarli come base di partenza per la pianificazione degli esperimenti successivi.

4. Abilità comunicative
Gli studenti dovranno avere la capacità di trasmettere le conoscenze acquisite in modo chiaro e comprensibile, anche a persone non competenti, e dovranno dimostrare l’abilità di presentare l’informazione anche con grafici e formule.

5. Capacità di apprendere
Condizione di successo nell’apprendimento è la capacità di leggere e comprendere un lavoro scientifico di argomento biochimico.




Scheda Docente

Programma del corso

Parte teorica (40 ore):
- I principi dell’indagine biochimica.
- Soluzioni tampone e pH. Ionizzazione di amminoacidi e proteine in funzione del pH.
- Teoria degli errori; accuratezza e precisione.
- Tecniche di centrifugazione: principi base della sedimentazione; centrifughe e loro uso; rotori; metodi di separazione nella centrifugazione preparativa; centrifugazione differenziale; centrifugazione in gradiente di densità; ultracentrifugazione analitica.
- Strategie di purificazione proteica; lisi cellulare ed estrazione proteica; dialisi ed ultrafiltrazione; precipitazione frazionata con sali, con solventi organici, al punto isoelettrico, al calore.
- Spettrofotometria: leggi ed applicazioni; legge di Lambert-Beer; gruppi cromofori e spettri di assorbimento di proteine ed acidi nucleici; metodi spettrofotometrici per la determinazione della concentrazione delle proteine: metodo del Biureto, di Lowry e di Bradford; dosaggio enzimatico.
- Metodi cromatografici: cromatografia per assorbimento, di ripartizione, di affinità, ad esclusione molecolare, a scambio ionico, di interazione idrofobica, cromatografia liquida a fase inversa, HPLC.
- Tecniche elettroforetiche: teoria, leggi, apparati; classificazione dei metodi elettroforetici; elettroforesi di agarosio, acrilammide e SDS-PAGE; tecniche di rivelazione e colorazione dei gel elettroforetici; elettroforesi bidimensionale classica (2-DE) e analisi differenziale su gel (tecnologia DIGE).
- Tecniche immunochimiche: western blot; immunoprecipitazione e immunoaffinità come strategie per l’analisi dei complessi proteici e delle interazioni proteiche.
- Metodologie biochimiche applicate alla moderna proteomica.

Parte pratica (8 ore):
- Lisi cellulare ed estrazione di proteine da matrici biologiche.
- Determinazione della concentrazione proteica di un campione incognito mediante il metodo spettrofotometrico di Bradford.
- Preparazione di un gel di poliacrilammide in presenza di SDS (SDS-PAGE) e Illustrazione degli apparati per l'elettroforesi e/o western blotting.
- Corsa elettroforetica e determinazione del peso molecolare di proteine mediante SDS-PAGE.

Modalità Esame

L’accertamento dell’effettiva acquisizione dei risultati d’apprendimento (sopra descritti) avverrà mediante una prova di esame orale.
Tale esame sarà volto a valutare le capacità raggiunte dallo studente in relazione alla conoscenza e comprensione delle basi teoriche e delle applicazioni in campo biologico delle diverse metodologie preparative e analitiche trattate durante le parte teorica del corso. Nella valutazione della prova e nell'attribuzione del voto finale si terrà anche conto della capacità di analisi, di sintesi, della padronanza di espressione e della capacità di fare collegamenti fra i vari argomenti trattati.

Allo studente saranno rivolte domande (generalmente 3) nell’ambito delle seguenti tematiche:
Strategie per isolare e purificare proteine;
tecniche di separazione in un laboratorio di Biochimica;
procedure biochimiche per l'analisi quantitative e qualitative.

Testi adottati

- Bonaccorsi di Patti M. C., Contestabile R., Di Salvo M. L. Metodologie biochimiche. Prima ed., 2012, Casa Editrice Ambrosiana.
- De Marco C., Cini C., Principi di metodologia biochimica. Prima ed., 2009, Piccin Nuova Libraria.
- Stoppini M., Bellotti V., Biochimica Applicata. Prima ed., 2012, EdiSES.
- Reed R., Holmes D., Weyers J., Jones A. Metodologie di base per le scienze biomolecolari. Prima ed., 2002, Zanichelli editore.

Per le attività pratiche di laboratorio vengono fornite dispense dal docente.


Modalità di svolgimento

L’insegnamento prevede lezioni frontali in aula (40 ore) e attività di laboratorio (8 ore) volte all’approfondimento pratico delle nozioni impartite.
Le lezioni frontali sono realizzate con il supporto di presentazioni ppt.

Per garantire una migliore fruibilità delle esercitazioni gli studenti saranno suddivisi in piccoli gruppi e, durante le attività pratiche, saranno seguiti dal docente e da un cultore della materia con funzione di esercitatore.
Non viene imposto l'obbligo di frequenza, ma è vivamente consigliato agli studenti frequentanti di seguire anche le attività pratiche di laboratorio.

Modalità di frequenza

Frequenza raccomandata ma facoltativa

Bibliografia

Vedi "Testi adottati".

PRINCIPI DI VACCINOLOGIA E BIOFARMACEUTICA

DANIELE PIETRUCCI

6BIO/13ita

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

Il corso prevede l’insegnamento delle cause biologiche che portano allo sviluppo di alcune patologie e l’applicazione delle principali biotecnologie in ambito biofarmaceutico, con particolare enfasi riguardo i vaccini. Nella prima parte del corso vengono trattati temi di carattere generale, quali lo studio delle malattie ereditarie, la patologia ambientale, i microorganismi patogeni e le malattie infettive, il sistema immunitario e i tumori. Verranno fornite nozioni relative alla farmacologia. Nella seconda parte del corso verranno forniti informazioni sui vaccini, sul loro sviluppo e su determinati microorganismi patogeni. Nell’ultima parte del corso vengono trattati gli aspetti bioinformatici e i principali programmi usati in ambito biofarmaceutico.

Modalità Esame

La valutazione prevede una prova scritta con quattro domande aperte. Ogni domanda vale 8 punti. Se lo studente acquisisce un voto pari o superiore a 31 la votazione finale sarà 30 e lode.

Testi adottati

Sono consigliati i seguenti testi:
PATOLOGIA GENERALE E FISIOPATOLOGIA 2/ED di Jeanette Anne Marie Maier - Mc Graw Hill Editore
LE BASI PATOLOGICHE DELLE MALATTIE di Robbins e Cotrane– Feltrinelli Editore
Saranno fornite allo studente delle slide sulla piattaforma MOODLE per integrazione

Bibliografia

Sono consigliati i seguenti testi:
PATOLOGIA GENERALE E FISIOPATOLOGIA 2/ED di Jeanette Anne Marie Maier - Mc Graw Hill Editore
LE BASI PATOLOGICHE DELLE MALATTIE di Robbins e Cotrane– Feltrinelli Editore
Saranno fornite allo studente delle slide sulla piattaforma MOODLE per integrazione

118979 - CHIMICA E BIOTECNOLOGIE DELLE FERMENTAZIONI - 12- -

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

CHIMICA E BIOTECNOLOGIE DELLE FERMENTAZIONI

RENéE ABOU JAOUDE'

6CHIM/11ita

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

Biocatalizzatori di interesse industriale e processi biotecnologici:
1) Catalizzatori biologici e tipologie di processi;
2) Fasi di un processo biotecnologico.

Isolamento e miglioramento di microrganismi di interesse industriale:
1) Isolamento di batteri, lieviti e funghi filamentosi

Materie prime e terreni di coltura impiegati nei processi fermentativi:
1) Terreni per colture sommerse, di superficie e su stato solido;
2) Formulazione del terreno di coltura;
3) Acqua;
4) Fonti di carbonio, azoto, fosforo ed energia;
5) Sali minerali;
6) Fattori di crescita;
8) Tamponi;
9) Precursori e regolatori metabolici;
10) Ossigeno;
11) Antischiuma;
12) Ottimizzazione della formulazione del terreno di coltura.

Sterilizzazione:
1) Sterilizzazione del terreno, del fermentatore, delle linee di alimentazione;
2) Processi di sterilizzazione in batch e in continuo;
3) Sterilizzazione mediante filtrazione.

ESERCITAZIONI in LABORATORIO:
1) Isolamento di ceppi microbici per la produzione di enzimi e/o metaboliti intra- ed extracellulari;
2) Allestimento e analisi di colture in batch e determinazione della crescita microbica;
3) Dosaggio di nutrienti e prodotti.

SEMINARI

VISITE DIDATTICHE

Modalità Esame

Lo studente dovrà dimostrare di aver appreso tutti gli argomenti del programma del modulo. La verifica delle conoscenze e delle abilità acquisite sarà verificata mediante:
- un esame scritto su tutti gli argomenti del programma (60% della valutazione finale);
- relazioni in itinere e relazioni scritte sulle esercitazioni di laboratorio (40% della valutazione finale).

Testi adottati

"Principles of Fermentation Technology" (3rd ed.)
Peter Stanbury, Allan Whitaker & Stephen Hall
Elsevier (2016) - ISBN: 9780080999531
Cap. 1-3-4-5

Modalità di frequenza

Facoltativa (ma fortemente consigliata).

Bibliografia


Materiale integrativo fornito tramite Google Classroom.

Scheda Docente

Programma del corso

Lezioni in aula
Miglioramento genetico di ceppi industriali.
Tecniche di conservazione dei microrganismi industriali.
Modalità di preparazione degli inoculi microbici (microrganismi sporigeni e non sporigeni).
Criteri per l’inoculo di colture sommerse e a stato solido.
Recupero e purificazione dei prodotti di fermentazione.
Esempi di processi fermentativi di interesse industriale.

Esercitazioni di chimica e biotecnologie delle fermentazioni.

Modalità Esame

Lo studente dovrà dimostrare di aver appreso tutti gli argomenti del programma del modulo. La verifica delle conoscenze e delle abilità acquisite sarà verificata mediante:
- un esame scritto su tutti gli argomenti del programma;
- la stesura di un progetto;
- relazioni scritte sulle esercitazioni di laboratorio.

Testi adottati

"Principles of Fermentation Technology" (3rd ed.)
Peter Stanbury, Allan Whitaker & Stephen Hall
Elsevier (2016) - ISBN: 9780080999531
Cap. 1-6

Materiale integrativo fornito tramite Google Classroom

Modalità di svolgimento

lezioni, esercitazioni di laboratorio, seminari, work groups e visite didattiche

Modalità di frequenza

lezioni, esercitazioni di laboratorio, seminari, work groups e visite didattiche

Bibliografia

"Principles of Fermentation Technology" (3rd ed.)
Peter Stanbury, Allan Whitaker & Stephen Hall
Elsevier (2016) - ISBN: 9780080999531
Cap. 1-6

Materiale integrativo fornito tramite Google Classroom

Obiettivi formativi

OBIETTIVI FORMATIVI:

il corso di scienze 'OMICHE' si propone di guidare lo studente in un percorso che parte dalle nozioni base della chimica delle proteine per arrivare alle loro più ampie e recenti applicazioni nello studio globale delle proteine espresse in specifiche condizioni o delle interazioni proteina-proteina al fine di definire il ruolo funzionale di una proteina nel contesto biologico di appartenenza. Durante il corso gli studenti acquisiranno nozioni sulle principali tecniche analitiche e preparative impiegate in studi di proteomica e competenze teorico-pratiche nell’identificazione di proteine e nell’interpretazione di spettri di massa MALDI ed ESI in applicazioni biomolecolari.

b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI:
1) Conoscenza e capacità di comprensione:
Aver acquisito una buona capacità di comprensione delle scienze omiche in ambito biotecnologico

2) Conoscenza e capacità di comprensione applicata:
Saper integrare le conoscenze acquisite nelle singole discipline in un sapere interdisciplinare necessario per affrontare qualsiasi problema complesso nel settore delle biotecnologie in particolare saper applicare le conoscenze di spettrometria di massa alle diverse applicazioni relative alle biotecnologie.

3 ) Autonomia di giudizio
Gli studentid dovranno sviluppare la capacità di elaborare informazioni complesse e/o frammentarie e di pervenire a idee e giudizi originali e autonomii capace di reperire e selezionare criticamente le sorgenti di dati bibliografici , banche dati, e la
letteratura in campo scientifico. L'autonomia di giudizio viene sviluppata tramite lo studio critico di articoli scientifici.

4) Abilità comunicative:
Lo studente sarà in grado di sostenere una discussione critica pubblica sugli argomenti trattati in particolare sarà capace di applicare le tecniche di proteomica per qualsiasi argomento scientifico di interesse.. Sarà capace di lavorare in gruppo nell'ambito della progettazione ed esecuzione di protocolli sperimentali perchè sono previsti crediti di laboratorio.

5) Capacità di apprendere:
Lo studente avrà la capacità di individuare, applicare e sviluppare tecniche innovative nel campo di pertinenza, di
lavorare in modo autonomo.

Scheda Docente

Programma del corso

PRINCIPI DI SCIENZE “OMICHE”
Introduzione:
• Scienze “omiche” e biologia dei sistemi complessi.
• La rivoluzione dell'ipotesi a posteriori e la ricerca di nuove ipotesi.
• Cosa sono le scienze “omiche”?.
• Dalle proteine alla proteomica, dai metaboliti alla metabolomica e dai lipidi alla lipidomica.
• Relazione tra la proteomica e le altre scienze post-genomiche.
Piattaforme tecnologiche:
• Preparazione del campione (piante, batteri, animali): preparazione dell’estratto proteico per analisi DIGE, linee generali di preparazione dei campioni per analisi LC-MS.
• Analisi dell’espressione proteica, di metaboliti e di lipidi mediante tecniche elettroforetiche
o Applicazioni dell’ SDS-PAGE e dell’IEF alla proteomica, metabolomica e lipidomica.
o DIfferential Gel Electrophoresis (DIGE), 2D-DIGE a saturazione
o Elettroforesi capillare (CE), elettroforesi bidimensionale (2DE).
o Applicazioni della 2-DE in proteomica: limiti e prospettive.
o Elettroforesi Blu Nativa su gel di poliacrilammide (Blue Native PAGE).
o Clear Native PAGE (CN-PAGE).
o Elettroforesi ‘gel free’
o Elettroforesi su acetato di cellulosa
• Metodi di rivelazione post analisi: Colorazione inversa, Coloranti fluorescenti, Analisi d’immagine per tecnologie multiplexing
• Metodi di rivelazione di modifiche post-traduzionali in spettrometria di massa:
o Glicosilazione, Fosforilazione, Nitrazione, Carbonilazione
• Analisi dell’espressione proteica mediante tecniche cromatografiche:
o Approccio proteomico Bottom-up
o Approccio proteomico Middle-down
o Approccio proteomico top-down
o Separazioni multidimensionali
• Spettrometria di massa: introduzione e concetti di risoluzione ed accuratezza
o Le sorgenti più impiegate in ambito proteomico: MALDI, ESI
o Le sorgenti più impiegate in campo metabolomico: EI
o Le sorgenti più impiegate in campo lipidomico: ESI, MALDI
o Gli analizzatori: quadrupolari, TOF, e trappole ionica, ORBITRAP, ibridi
• La spettrometria di massa tandem (MS\MS)
Metodi quantitativi: sistemi di cromatografia liquida (LC) a fase inversa (RP) accoppiata ad analisi di spettrometria di massa.
o Strategie di quantificazione relativa basate sulla marcatura con isotopi stabili (iTRAQ, SILAC spike-in, Super-SILAC e organismi SILAC, ICAT, O18)
o Strategie di quantificazione relativa senza marcatura (metodiche “label-free”: intensity-based e spectral-counting, calcolo del PAI e dell’emPAI).
o Proteomica , metabolomica e lipidomica quantitativa mirata: SRM
Tecniche accoppiate: GC-MS, EC-MS, LC-MS\MS, MudPIT

Anna Maria Timperio

Modalità Esame

L'esame si svolge nelle forme stabilite dall'art. 23 del Regolamento Didattico di Ateneo. Del suo svolgimento viene redatto apposito verbale, sottoscritto dal Presidente e dai membri della commissione e dallo studente esaminato. Il voto è espresso in trentesimi, con eventuale lode. Il superamento dell'esame presuppone il conferimento di un voto non inferiore ai diciotto/trentesimi e comporta l'attribuzione dei corrispondenti crediti formativi universitari. Nella valutazione delle prova e nell’ attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici (errori nell’applicare i concetti, discreta, buona, ben consolidata), della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta).

Testi adottati

T. Alberio, M. Fasano, P. Roncada "PROTEOMICA" EdiSES; I. Lavagnini, F. Magno, R. Seraglia e P. Traldi "Quantitative Applications of Mass Spectrometry (English Edition)" WILEY.

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali in aula supportate da presentazioni in PowerPoint con figure, schemi di processo e video. Per tale attività sono previste 40 ore. Sono previste anche esercitazioni in laboratorio didattico che metteranno gli studenti in condizione di prendere confidenza con la preparazione dei tamponi e estrazioni di materiale biologico, determinazione di proteine e loro analisi in spettrometria di massa. Per questa attività sono previste 8 ore.

Modalità di frequenza

Lezioni frontali in aula supportate da presentazioni in PowerPoint con figure, schemi di processo e video. Per tale attività sono previste 40 ore. Sono previste anche esercitazioni in laboratorio didattico che metteranno gli studenti in condizione di prendere confidenza con la preparazione dei tamponi e estrazioni di materiale biologico, determinazione di proteine e loro analisi in spettrometria di massa. Per questa attività sono previste 8 ore.

Bibliografia

Liebler DC. Introduction to proteomics: tools for the new biology. Totowa, NJ: Humana Press
2002.
Rivista Società Italiana di Medicina Generale N.5 VOL.25 2018

Obiettivi formativi

a) OBIETTIVI FORMATIVI
Comprendere gli elementi di base della fisiologia e neurofisiologia del sistema nervoso centrale, ed in particolare saper descrivere: gli eventi generali che portano alla formazione delle principali aree del cervello e delle sinapsi, i meccanismi generali di riparazione e rigenerazione, le basi del controllo del movimento, le funzioni cerebrali complesse, le caratteristiche generali di malattie neurodegenerative, i metodi che si possono applicare nell’ambito delle neuroscienze

b) RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI (Descrittori di Dublino)
CONOSCENZA E CAPACITA' DI COMPRENSIONE: Per il superamento dell’esame lo studente dovrà dimostrare di aver raggiunto una conoscenza e una capacità di comprensione delle tematiche inerenti al funzionamento del sistema nervoso centrale, alla neurodegenerazione e alle neurotecnologie che gli permetta di impostare la discussione di problematiche teoriche in modo logico e completo.
CAPACITA' DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: Lo studente dovrà dimostrare di saper impostare la trattazione di problemi applicativi nell'ambito delle neuroscienze e neurotecnologie.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Lo studente dovrà avere acquisito conoscenze tali da permettergli di descrivere i meccanismi alla base delle funzioni trattate e saper valutare in modo autonomo e motivato eventuali opinioni diverse su eventuali aspetti problematici.
ABILITA' COMUNICATIVE: Al termine del corso, lo studente dovrà aver raggiunto un'appropriata organizzazione di un proprio pensiero, intorno alle diverse tematiche del corso, da permettergli di esporre gli argomenti in forma organica e con linguaggio scientifico appropriato.
CAPACITA' DI APPRENDIMENTO: Lo studente dovrà essere capace di esaminare e comprendere testi e materiale scientifico, in modo tale da impiegarli in contesti quotidiani per la professione e per la ricerca.

Scheda Docente

Programma del corso

Sviluppo del sistema nervoso, formazione delle principali aree e delle sinapsi, identità e circuiteria neuronale, riparazione e rigenerazione
Sistema nervoso centrale e neurotrasmissione
Controllo centrale del movimento
Funzioni cerebrali complesse: apprendimento e memoria, ritmo sonno-veglia, rappresentazioni neurali delle emozioni e della coscienza, linguaggio
Malattie neurodegenerative e disturbi del sistema nervoso centrale, cenni
Metodi nelle neuroscienze: elettrofisiologia, elettroencefalografia, flusso sanguigno del cervello, neuroimaging, stimolazione e misurazione dell’attività neurale, modelli in vitro/ex vivo/in vivo di cellule/tessuti del SNC, modelli di barriera ematoencefalica, colture organotipiche

Modalità Esame

Lo studente deve dimostrare di aver acquisito i principi di base che regolano il sistema nervoso centrale e le metodologie che si possono applicare nel campo delle neuroscienze. La conoscenza e la padronanza degli argomenti, la chiarezza espositiva, la visione della disciplina e l'uso corretto della terminologia tecnica saranno considerati come elementi di valutazione (espresso in 30esimi; sufficiente 18).

Testi adottati

- Neuroscienze, autori Purves, Augustine, Fitzpatrick, Hall, Lamantia, Mooney, casa editrice Zanichelli
- Neuroscienze cognitive, autori Gazzaniga, Ivry, Mangun, casa editrice Zanichelli
- Principi di neuroscienze, autori Kandel, Schwartz, Jessel, Siegelbaum, Hudspeth, casa editrice Ambrosiana
- Neuroscienze Esplorando il cervello, autori Bear, Connors, Paradiso, casa editrice Edra
- possono comunque andare bene anche altri testi di Fisiologia umana, purché aggiornati
- articoli scientifici selezionati dal docente
-“slides” delle lezioni messe a disposizione dal docente a fine corso sulla piattaforma istituzionale (importanti come integrazione dettagliata del programma svolto)

Modalità di svolgimento

Lezioni frontali

Modalità di frequenza

La partecipazione alle lezioni non è obbligatoria

Bibliografia

vedere i libri di testo consigliati

Obiettivi formativi

OBIETTIVI FORMATIVI
L’insegnamento di Metodologie Biochimiche intende fornire agli studenti un quadro teorico e pratico di alcune delle principali metodiche preparative e analitiche che trovano impiego non solo nel campo della ricerca biochimica, ma anche in altri campi tra cui quello biomedico e ambientale.
In particolare, le conoscenze impartite riguardano metodologie per l’identificazione, l’isolamento e lo studio strutturale e funzionale delle macromolecole biologiche, nonché strumenti di bioinformatica per l'analisi dei risultati sperimentali e per la loro descrizione. Verranno, inoltre, trattate tecniche per l’analisi sia delle singole proteine che di interi proteomi.

RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI
1. Conoscenza e capacità di comprensione
Al termine del corso gli studenti
- conosceranno i principi alla base delle tecniche impiegate nelle indagini biochimiche (centrifugazione, spettroscopia, elettroforesi, cromatografia, spettrometria) ed i parametri su cui poter agire per mettere a punto una particolare indagine biochimica;
- saranno in grado di descrivere gli elementi strutturali dei principali strumenti di un laboratorio biochimico (centrifuga, spettrofotometro, spettrometro);
- conosceranno correttamente la terminologia appropriata impiegata nelle metodologie biochimiche.

2. Conoscenza e capacità di comprensione applicate
Al termine del corso gli studenti
- saranno in grado di orientarsi correttamente sulla scelta delle più opportune procedure biochimiche per il raggiungimento degli obiettivi sperimentali definiti in fase di progettazione della ricerca;
- sapranno valutare il possibile impatto delle variazioni dei parametri in gioco in un esperimento biochimico e nelle principali indagini strumentali cliniche;
- sapranno svolgere praticamente gli esperimenti affrontati nella parte di laboratorio.

3. Autonomia di giudizio
Gli studenti dovranno essere in grado di comprendere e discutere criticamente i risultati sperimentali ottenuti in laboratorio ed utilizzarli come base di partenza per la pianificazione degli esperimenti successivi.

4. Abilità comunicative
Gli studenti dovranno avere la capacità di trasmettere le conoscenze acquisite in modo chiaro e comprensibile, anche a persone non competenti, e dovranno dimostrare l’abilità di presentare l’informazione anche con grafici e formule.

5. Capacità di apprendere
Condizione di successo nell’apprendimento è la capacità di leggere e comprendere un lavoro scientifico di argomento biochimico.




Scheda Docente

Programma del corso

Parte teorica (40 ore):
- I principi dell’indagine biochimica.
- Soluzioni tampone e pH. Ionizzazione di amminoacidi e proteine in funzione del pH.
- Teoria degli errori; accuratezza e precisione.
- Tecniche di centrifugazione: principi base della sedimentazione; centrifughe e loro uso; rotori; metodi di separazione nella centrifugazione preparativa; centrifugazione differenziale; centrifugazione in gradiente di densità; ultracentrifugazione analitica.
- Strategie di purificazione proteica; lisi cellulare ed estrazione proteica; dialisi ed ultrafiltrazione; precipitazione frazionata con sali, con solventi organici, al punto isoelettrico, al calore.
- Spettrofotometria: leggi ed applicazioni; legge di Lambert-Beer; gruppi cromofori e spettri di assorbimento di proteine ed acidi nucleici; metodi spettrofotometrici per la determinazione della concentrazione delle proteine: metodo del Biureto, di Lowry e di Bradford; dosaggio enzimatico.
- Metodi cromatografici: cromatografia per assorbimento, di ripartizione, di affinità, ad esclusione molecolare, a scambio ionico, di interazione idrofobica, cromatografia liquida a fase inversa, HPLC.
- Tecniche elettroforetiche: teoria, leggi, apparati; classificazione dei metodi elettroforetici; elettroforesi di agarosio, acrilammide e SDS-PAGE; tecniche di rivelazione e colorazione dei gel elettroforetici; elettroforesi bidimensionale classica (2-DE) e analisi differenziale su gel (tecnologia DIGE).
- Tecniche immunochimiche: western blot; immunoprecipitazione e immunoaffinità come strategie per l’analisi dei complessi proteici e delle interazioni proteiche.
- Metodologie biochimiche applicate alla moderna proteomica.

Parte pratica (8 ore):
- Lisi cellulare ed estrazione di proteine da matrici biologiche.
- Determinazione della concentrazione proteica di un campione incognito mediante il metodo spettrofotometrico di Bradford.
- Preparazione di un gel di poliacrilammide in presenza di SDS (SDS-PAGE) e Illustrazione degli apparati per l'elettroforesi e/o western blotting.
- Corsa elettroforetica e determinazione del peso molecolare di proteine mediante SDS-PAGE.

Modalità Esame

L’accertamento dell’effettiva acquisizione dei risultati d’apprendimento (sopra descritti) avverrà mediante una prova di esame orale.
Tale esame sarà volto a valutare le capacità raggiunte dallo studente in relazione alla conoscenza e comprensione delle basi teoriche e delle applicazioni in campo biologico delle diverse metodologie preparative e analitiche trattate durante le parte teorica del corso. Nella valutazione della prova e nell'attribuzione del voto finale si terrà anche conto della capacità di analisi, di sintesi, della padronanza di espressione e della capacità di fare collegamenti fra i vari argomenti trattati.

Allo studente saranno rivolte domande (generalmente 3) nell’ambito delle seguenti tematiche:
Strategie per isolare e purificare proteine;
tecniche di separazione in un laboratorio di Biochimica;
procedure biochimiche per l'analisi quantitative e qualitative.

Testi adottati

- Bonaccorsi di Patti M. C., Contestabile R., Di Salvo M. L. Metodologie biochimiche. Prima ed., 2012, Casa Editrice Ambrosiana.
- De Marco C., Cini C., Principi di metodologia biochimica. Prima ed., 2009, Piccin Nuova Libraria.
- Stoppini M., Bellotti V., Biochimica Applicata. Prima ed., 2012, EdiSES.
- Reed R., Holmes D., Weyers J., Jones A. Metodologie di base per le scienze biomolecolari. Prima ed., 2002, Zanichelli editore.

Per le attività pratiche di laboratorio vengono fornite dispense dal docente.


Modalità di svolgimento

L’insegnamento prevede lezioni frontali in aula (40 ore) e attività di laboratorio (8 ore) volte all’approfondimento pratico delle nozioni impartite.
Le lezioni frontali sono realizzate con il supporto di presentazioni ppt.

Per garantire una migliore fruibilità delle esercitazioni gli studenti saranno suddivisi in piccoli gruppi e, durante le attività pratiche, saranno seguiti dal docente e da un cultore della materia con funzione di esercitatore.
Non viene imposto l'obbligo di frequenza, ma è vivamente consigliato agli studenti frequentanti di seguire anche le attività pratiche di laboratorio.

Modalità di frequenza

Frequenza raccomandata ma facoltativa

Bibliografia

Vedi "Testi adottati".

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

Il corso prevede l’insegnamento delle cause biologiche che portano allo sviluppo di alcune patologie e l’applicazione delle principali biotecnologie in ambito biofarmaceutico, con particolare enfasi riguardo i vaccini. Nella prima parte del corso vengono trattati temi di carattere generale, quali lo studio delle malattie ereditarie, la patologia ambientale, i microorganismi patogeni e le malattie infettive, il sistema immunitario e i tumori. Verranno fornite nozioni relative alla farmacologia. Nella seconda parte del corso verranno forniti informazioni sui vaccini, sul loro sviluppo e su determinati microorganismi patogeni. Nell’ultima parte del corso vengono trattati gli aspetti bioinformatici e i principali programmi usati in ambito biofarmaceutico.

Modalità Esame

La valutazione prevede una prova scritta con quattro domande aperte. Ogni domanda vale 8 punti. Se lo studente acquisisce un voto pari o superiore a 31 la votazione finale sarà 30 e lode.

Testi adottati

Sono consigliati i seguenti testi:
PATOLOGIA GENERALE E FISIOPATOLOGIA 2/ED di Jeanette Anne Marie Maier - Mc Graw Hill Editore
LE BASI PATOLOGICHE DELLE MALATTIE di Robbins e Cotrane– Feltrinelli Editore
Saranno fornite allo studente delle slide sulla piattaforma MOODLE per integrazione

Bibliografia

Sono consigliati i seguenti testi:
PATOLOGIA GENERALE E FISIOPATOLOGIA 2/ED di Jeanette Anne Marie Maier - Mc Graw Hill Editore
LE BASI PATOLOGICHE DELLE MALATTIE di Robbins e Cotrane– Feltrinelli Editore
Saranno fornite allo studente delle slide sulla piattaforma MOODLE per integrazione

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

Il corso di Applicazioni biotecnologiche delle sostanze vegetali offre un'esplorazione approfondita dei diversi modi in cui le sostanze vegetali vengono utilizzate nelle biotecnologie. Gli studenti acquisiranno una comprensione completa dei principi, delle tecniche e delle applicazioni delle biotecnologie in vari campi, quali la farmaceutica, l'agricoltura, l'industria alimentare e la sostenibilità ambientale. Attraverso una combinazione di lezioni, esercitazioni di laboratorio e casi di studio, gli studenti svilupperanno le conoscenze e le competenze necessarie per sfruttare il potenziale delle sostanze naturali per scopi scientifici e industriali.

Struttura del corso:
Introduzione alle applicazioni biotecnologiche delle sostanze vegetali. Panoramica della biotecnologia e del suo rapporto con le sostanze vegetali. Contesto storico e tappe fondamentali delle applicazioni biotecnologiche. Considerazioni etiche e quadri normativi nelle biotecnologie
Fondamenti delle sostanze naturali. Cosa sono le sostanze naturali. Sostanze naturali di origine vegetale. Sostanze naturali da piante marine. Sostanze vegetali e molecole di sintesi. L’utilizzo di sostanze vegetali nel corso del tempo. Le sostanze vegetali oggi e loro impiego in differenti culture. Applicazioni biotecnologiche delle sostanze vegetali: impieghi in ambiente, nell’erboristeria, nella farmaceutica, nell’industria del tessile, nell’industria alimentare. Classificazione e proprietà delle sostanze vegetali. Fonti e tecniche di estrazione. Metodi analitici per la caratterizzazione delle sostanze vegetali.
Ingegneria genetica e sostanze vegetali. Introduzione alle tecniche di ingegneria genetica. Applicazione dell'ingegneria genetica nella modifica delle sostanze vegetali. Casi di studio sugli organismi geneticamente modificati (OGM)
Sostanze vegetali nella biotecnologia farmaceutica. Scoperta e sviluppo di farmaci utilizzando sostanze vegetali. Ricerca e screening dei prodotti naturali. Produzione di proteine ricombinanti e biofarmaci
Sostanze naturali in agricoltura. La biotecnologia nel miglioramento delle colture e nella modificazione genetica. Biofertilizzanti e biopesticidi derivati da sostanze vegetali. Pratiche di agricoltura sostenibile con le biotecnologie
Sostanze vegetali nella trasformazione alimentare. Conservazione e miglioramento della qualità degli alimenti con le biotecnologie
Biorisanamento e applicazioni ambientali. Sostanze vegetali per il risanamento ambientale. Biodegradazione degli inquinanti con le biotecnologie. Soluzioni biotecnologiche per la gestione dei rifiuti.
Biocarburanti ed energie rinnovabili. Approcci biotecnologici per la produzione di biocarburanti. Conversione di sostanze vegetali in fonti energetiche. Sostenibilità e impatto ambientale della bioenergia.
Sostanze vegetali nei cosmetici e nella cura della persona. Le biotecnologie nell'industria cosmetica. Estrazione e formulazione di sostanze vegetali nei prodotti per la cura della persona. Considerazioni sulla sicurezza e sulle normative nella biotecnologia cosmetica.
Biotecnologie e medicina tradizionale. Integrazione tra medicina tradizionale e biotecnologia. Prodotti naturali nella medicina tradizionale e loro moderne applicazioni. Sfide e opportunità nel collegare le conoscenze tradizionali con la biotecnologia
Argomenti avanzati e casi di studio. Esplorazione approfondita di specifiche applicazioni biotecnologiche di sostanze vegetali. Conferenze di esperti e ricercatori del settore. Casi di studio e progetti di gruppo su applicazioni reali
Nota: la struttura del corso qui fornita è un quadro generale e può essere personalizzata in base ai destinatari, alle risorse disponibili e agli interessi specifici nel campo delle applicazioni biotecnologiche delle sostanze naturali.

Modalità Esame

L'obiettivo della prova orale è verificare la capacità di apprendimento della materia, la capacità di saper ragionare sugli argomenti trattati nel Corso e la capacità di esposizione.
Per l’attribuzione del voto finale si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato (superficiale, appropriato, preciso e completo, completo e approfondito), della capacità di applicare i concetti teorici, della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari (sufficiente, buona, ottima), della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi (sufficiente, buona, ottima), della padronanza di espressione (esposizione carente, semplice, chiara e corretta, sicura e corretta

Testi adottati

- Pasqua G., Forni C. Biotecnologie Vegetali, Piccin Editore, Padova.

Il Docente mette a disposizione tutte le diapositive ed i filmati mostrati durante il Corso.

Modalità di frequenza

La frequenza del corso e delle esercitazioni non è obbligatoria. Tuttavia la partecipazione degli studenti alle lezioni frontali e alle esercitazioni fornisce strumenti aggiuntivi all'ottenimento degli obiettivi forativi del corso.

Bibliografia

Vedi testi adottati.
Durante il corso saranno mensionati riferimenti bibliografici utili all'approfondimento; ogni riferimento citato è inserito nelle diapositive del corso disponibili agli studenti.

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

La qualità dei prodotti alimentari vegetali. Principali processi di trasformazioni post raccolta degli ortofrutticoli. (0.5CFU) Fisiologia dei prodotti vegetali: cause di deperibilità e di decadimento nutrizionale. Prodotti di IV gamma. (0.5CFU) Scelta delle applicazioni tecnologiche postraccolta. (0.5CFU) Biosintesi dell'etilene. Etilene: frutti climaterici e frutti non climaterici. Ruolo dell’ACO e dell’ACS (studio del melone ACC ossiadasi antisenso) Competenza del frutto alla maturazione Percezione e trasduzione del segnale. Studi molecolari sulla maturazione di alcuni frutti. (2CFU)
Standards di qualità, norme alimentari, fattori di deperibilità dei prodotti. Inbitori biologici, chimici e di azione dell'etilene. Indici di maturazione e di qualità. Alterazioni dei prodotti in postraccolta. (1CFU)
Principi di tecnica frigorifera: ciclo frigorifero, tecniche di prerefrigerazione. La conservazione refrigerata. Il condizionamento dei prodotti ortofrutticoli. Le atmosfere controllate e modificate. Nuove tecnologie: utilizzo dell'ozono. (1.5CFU)

Modalità Esame

La preparazione sarà accertata attraverso la valutazione delle risposte fornite in forma orale o scritta dallo studente a quattro, cinque domande sugli argomenti del programma del corso in oggetto. Nel caso della prova scritta le domande saranno poste in forma aperta ed il candidato avrà un massimo di due ore per fornire le risposte. Ai fini della valutazione per l’attribuzione del voto finale espresso in trentesimi (con votazione da 18 a 30) con eventuale lode), si terrà conto: del livello di conoscenza dei contenuti dimostrato, della capacità di applicare i concetti teorici, della capacità di analisi, di sintesi e di collegamenti interdisciplinari, della capacità di senso critico e di formulazione di giudizi e della padronanza di espressione.

Testi adottati

Dispense/materiale in formato elettronico forniti dal docente.
Conservazione degli Ortofrutticoli Autori Anelli e Mencarelli Edagricole.
Postharvest Physiology of Perishable Plant Products. Autore Stanley J. Kays. Exon Press, Athens, GA
Power Point del docente

Modalità di frequenza

La frequenza alle lezioni non è obbligatoria. Gli studenti sono vivamente invitati a partecipare in presenza alle lezioni frontali, alle esercitazioni, ai seminari ed alle visite didattiche che si svolgeranno durante il corso

Bibliografia

Cornelius S. Barry and James J. Giovannoni. Ethylene and Fruit Ripening. J Plant Growth Regul (2007) 26:143–159 DOI: 10.1007/s00344-007-9002-y
Lina Mayuoni, ZiporaTietel, Bhimanagouda S.Patil, Ron Porat. Does ethylene degreening affect internal quality of citrus fruit? Postharvest Biology and Technology
Vol. 62, Issue 1, October 2011, Pages 50-58.
J.C. Pech , M. Bouzayen, A. Latché. Climacteric fruit ripening: Ethylene-dependent and independent regulation of ripening pathways in melon fruit. Plant Science 175 (2008) 114–120.
Guis, M., Botondi, R., Ben-Amor, M., Ayub, R.,, Bouzayen, M., Pech, J.-C., Latché, A. Ripening-associated biochemical traits of Cantaloupe Charentais melons expressing an antisense ACC oxidase transgene. Journal of the American Society for Horticultural ScienceOpen Access Vol. 122, Issue 6, 1997, Pages 748-751.
Valentina Goffi, Luigi Zampella, Roberto Forniti, Milena Petriccione and Rinaldo Botondi. Effects of ozone postharvest treatment on physicochemical and qualitative traits of Actinidia chinensis ‘Soreli’ during cold storage. J Sci Food Agric (2019).
Rinaldo Botondi * , Marco Barone and Claudia Grasso. A Review into the Effectiveness of Ozone Technology for Improving the Safety and Preserving the Quality of Fresh-Cut Fruits and Vegetables. Foods 2021, 10, 748. https://doi.org/10.3390/foods10040748

Obiettivi formativi

1) Conoscenza e capacità di comprensione
2) Conoscenza e capacità di comprensione applicate
3) Autonomia di giudizio
4) Abilità comunicative
5) Capacità di apprendere

Scheda Docente

Programma del corso

• Introduzione alle Biotecnologie. Panoramica sulle Biotecnologie animali: definizione, origine, crescita delle biotecnologie, principali steps della ricerca biotecnologica nella storia. Biotecnologie, sostenibiltà ambientale e biodiversità.
• Origine ed evoluzione delle linee cellulari, trasferimento genico, implicazioni della manipolazione genica, esempi di proteine di importanza biomedica prodotte in colture cellulari. Ingegneria dei tessuti. Cellule staminali.
• Ingegneria genetica per la creazione di animali transgenici a scopi commerciali o di ricerca: origine e significato del DNA ricombinante applicato ad animali, clonazione, punti chiave del processo di clonazione, esempi di applicazione di animali transgenici in agricoltura, insidi e rischi di natura tecnica, commerciale, sanitaria ed etica coinvolti nell’utilizzo di animali transgenici
• Biotecnologie animali e Novel Foods. Sostenibilità ambientale. Normativa europea e nazionale.
Carne coltivata: Introduzione e inquadramento del tema, tecnologie per produzione, considerazioni ambientali, per la salute umana e etiche.
Entomofagia: allevamento sostenibile di insetti per la produzione di mangimi e di cibo. Esempi applicativi in Italia.
• Biotecnologie in acquacoltura: introduzione sull’importanza e necessità dell’acquacoltura, pesci transgenici - requisiti per la commercializzazione e conseguenze ecosistemiche, poliploidia.
• Biotecnologie applicate al mare (Blue biotechnology)
• Biotecnologie applicate alla conservazione della specie animali
• Molecole di interesse biotecnologico ottenute da phyla animali invertebrati: biodiversità come fonte biotecnologica, esempi di molecole estratte e applicazioni
• Trattazione di alcune questioni etiche relative all’utilizzo delle biotecnologie animali
• Progetto di gruppo e presentazione in aula da parte degli studenti (sviluppo capacità di analisi critica di un lavoro scientifico, esposizione pubblica, creazione di documenti multimediali a supporto della presentazione)

Modalità Esame

La prova orale si articola in genere su due domande, una di carattere generale sulle biotecnologie animali e la seconda di approfondimento su un argomento specifico. Durante la prova orale vengono accertate le conoscenze in relazione al programma trattato, la capacità di analisi, lo spirito critico, la padronanza di espressione e l'acquisizione di un linguaggio specifico, relativo alla materia.

Testi adottati

- Biotecnologie animali. Biotecnologie animali sostenibili: Bilanciare scienza ed etica
di Thenmozhi Mani, Vardhana Janakiraman. Edizioni Sapienza. ISBN-10 ‏ : ‎ 6205940779
ISBN-13 ‏ : ‎ 978-6205940778
- Biotechnology, fifth edition. Smith. Cambridge Press. ISBN: 9780521884945
- Recombinant DNA, second edition. Gilman, Witkowski, Zoller, Watson. Scientific American Books. ISBN: 0716722828
- Animal Biotechnology 2, Emerging Breeding Technologies. Niemann, Wrenzycki. Springer. ISBN: 9783319923475
- Aquaculture and Fisheries Biotechnology, Genetic Approaches. Dunham. CABI Publishing. ISBN: 9781450349185
- Carne coltivata. La rivoluzione a Tavola? Arianna Ferrari. Collana Icaro.Fanfango Libri 2024.

- Slide fornite dal docente

Modalità di frequenza

La frequenza, pur altamente consigliata, non è obbligatoria.

Obiettivi formativi

Obiettivo della disciplina è approfondire gli aspetti eziologici,biologici ed epidemiologici delle malattie delle piante provocate da fitopatogeni ed indicare criticamente gli approcci biotecnologici utilizzati in fitopatologia. Individuare le applicazioni biotecnologiche in campo agrario basate sull’uso di micororganismi.
RISULTATI DI APPRENDIMENTO ATTESI
Conoscenza e capacità di comprensione
Acquisizione di metodologie avanzate per lo sviluppo di approcci biotecnologici da utilizzare in agricoltura, in particolare per la difesa dai principali fitopatogeni.
Capacità di applicare conoscenza e comprensione
Capacità di eseguire autonomamente i rilievi e le elaborazioni necessarie per condurre un intervento di difesa fitosanitaria.
Autonomia di giudizio
Valutazione dei problemi fitopatologici e dei possibili approcci di difesa con metodi tradizionali e innovativi.
Abilità comunicative
Capacità di esporre i risultati degli studi svolti in linguaggio specifico, anche a un pubblico di non esperti.
Capacità d’apprendimento
Capacità di aggiornamento con la consultazione di pubblicazioni scientifiche e divulgative nazionali ed internazionali, proprie del settore

Scheda Docente

Programma del corso

diagnostica dei principali patogeni, Real-Time PCR, LAMP, HMR, Metagenomica, esempi di fitopatie e strategie di controllo. Micorizzazione Agenti di Biocontrollo, formulazione dei prodotti biologici. Casi di studio

Modalità Esame

orale, scritta, valutazione del progetto
La prova di accertamento è scritta e conterrà una serie di domande volte ad accertare la conoscenza teorica da parte dello studente sulle teorie esposte a lezione
l'obiettivo della prova orale è verificare la capacità comunicativa dello studente
L'obiettivo della valutazione del progetti gruppo è verificare la capacità di lavorare in gruppo e di affrontare problematiche specifiche

Testi adottati

Fondamenti di Patologia Vegetale – Alberto Matta
Plant Pathology – G.N. Agrios
Patologia Vegetale – Giuseppe Belli
Materiale su piattaforma MOODLE

Modalità di svolgimento

in presenza

Modalità di frequenza

lezioni in classe ed eserciazioni in laboratorio suole tematiche trattate durante le lezioni

Bibliografia

materiale aggiuntivo ( es. articoli scientfici, video) fornita durante il corso

GRUPPI INSEGNAMENTI A SCELTAANNO/SEMESTRECFUSSDLINGUA
GRUPPO OPZIONALE A11 PROFILO BIOLOGICO-INDUSTRIALE -12 - -
17720 - PRINCIPI DI SCIENZE OMICHE

ANNA MARIA TIMPERIO

Terzo Anno / Primo Semestre 6BIO/11ita
119532 - NEUROSCIENZE E NEUROTECNOLOGIE FONDAMENTALI

ELISABETTA CATALANI

Terzo Anno / Primo Semestre 6BIO/09ita
17531 - METODOLOGIE BIOCHIMICHE

ESTHER IMPERLINI

Terzo Anno / Secondo Semestre 6BIO/10ita
119533 - PRINCIPI DI VACCINOLOGIA E BIOFARMACEUTICA

DANIELE PIETRUCCI

Terzo Anno / Secondo Semestre 6BIO/13ita
GRUPPO OPZIONALE A12 PROFILO AGRO-AMBIENTALE -12 - -
119534 - APPLICAZIONI BIOTECNOLOGICHE DI SOSTANZE VEGETALI

VALENTINA LAGHEZZA MASCI

Terzo Anno / Primo Semestre 6BIO/01ita
119536 - BIOTECNOLOGIE DEI PRODOTTI ORTOFRUTTICOLI

RINALDO BOTONDI

Terzo Anno / Primo Semestre 6AGR/15ita
119535 - BIOTECNOLOGIE ANIMALI PER LA SOSTENIBILITà

VALENTINA DELLA BELLA

Terzo Anno / Secondo Semestre 6BIO/05ita
15054 - PATOLOGIA VEGETALE E PRINCIPI DI BIOTECNOLOGIE FITOPATOLOGICHE

ANNA MARIA VETTRAINO

Terzo Anno / Secondo Semestre 6AGR/12ita